故事的主人公吉姆，是一個十歲大的小男孩，吉姆的父母在黑山海灣旁經營一家旅館名為「本鮑上將」。有一天，旅館來了一位臉上帶著刀疤、身材高大結實、非常引人注目的客人，原來他就是比爾船長。吉姆非常喜歡聽比爾船長講故事，那些聽起來挺嚇人的經歷，像是罪犯被處以絞刑、海盜雙手被綁而且矇眼走跳板、突如其來的海上大風暴、遍地骨骸的西班牙海盜巢穴等，每次都讓吉姆又愛又怕，也讓寧靜的小鎮增添了不少新鮮刺激的話題。沒多久，比爾船長因為飲酒過量加上受到驚嚇而死在旅館中，吉姆無意間發現比爾身上帶著的一張藏寶圖，那是海盜普林特船長所遺留下的，於是吉姆和一群人的金銀島尋寶的故事就此展開。心懷不軌的海盜們喬裝成一般的水手，當中還包括陰森詭譎的獨腳水手西爾弗。大夥兒假裝跟著吉姆和利弗希醫生一起去尋寶，航海的過程中，充滿了千辛萬苦和千奇百怪的事。不僅發生了足以讓人喪命的瘧疾病亂，還曾經發生海盜們群體叛亂的恐怖事件。吉姆·霍金斯智鬥海盜，歷經千辛萬苦，終於找到寶藏，勝利而歸。