西班牙王室支援麥哲倫遠洋探險的原因有很多，比如說黃金、宗教等，但最主要的原因還是希望麥哲倫遠航能給西班牙帶來更多的殖民利益，從而在這一點上超過主要競爭對手--葡萄牙，成為最大殖民強國。　　33歲時，麥哲倫回到了家鄉葡萄牙。他向葡萄牙國王曼努埃爾申請組織船隊去探險，進行一次環球航行。可是，國王沒有答應，因為國王認為東方貿易已經得到有效的控制，沒有必要再去開闢新航道了。1517年，他離開了葡萄牙，來到了西班牙塞維利亞並又一次提出環球航行的請求。塞維利亞的要塞司令非常欣賞他的才能和勇氣，答應了他的請求，並把女兒也嫁給了他。　　1518年3月，西班牙國王查理五世(即卡洛斯一世)接見了麥哲倫，麥哲倫再次提出了航海的請求，並獻給了國王一個自制的精緻的彩色地球儀。國王很快就答應了他。1519年9月20日，在國王的指令下，麥哲倫組織了一支五艘船組成的船隊，以特里尼達號為旗艦，另外還有聖安東尼奧號、康塞普遜號、維多利亞號和聖地亞哥號，準備出航。