首先排水防澇：低窪的農田容易積澇，辣椒根部受到水淹會造成根系窒息。積水的辣椒地必須在幾個小時內排幹。在24個小時之內及時扶起倒伏植株，對於未封行的生長期辣椒，要及時扶起並用竹枝支撐。封行掛果期辣椒扶正時清除折損與過密的枝條，以保證株間的通透性。根據病害發生情況選用殺菌劑。防治細菌性病害和辣椒疫病放在首位。建議選用中生菌素或鏈黴素、鹼式氫氧化銅加可殺得等噴霧防細菌性病害；防治辣椒疫病可選用烯醯嗎啉或霜黴威。也可使用烯醯-醚菌酯、吡唑醚菌酯-霜黴威等復配藥劑。對於炭疽病流行的辣椒田宜選用苯甲-嘧菌酯、咪醯胺，而對有菌核病的辣椒田選用嘧黴胺或腐黴利。提高辣椒抗病力是搶救成敗的關鍵。對風雨後生長衰弱的辣椒噴永業生命素等優質葉面肥。可與殺菌劑一道噴施。並將附在莖葉植株上的泥漿沖刷。抓緊完成排水、扶正、噴藥、噴葉面肥等措施後，先適量澆水定根，後培土保護被雨水沖刷裸露的根系，待植株新根萌動再追施比較淡的水肥。