不按順序回答哈，總體上給你說說：

1、算跨專業，因為屬於不同的一級專業下面，不過都是在工科裡面

2、學校的專業實力：水利水電工程你是讀這個專業的相信也知道，河海大學第一的，另外就是武大了，因為合併了原來的武測繪和武水；航道的這個一般就是海事大學，交通類的大學比較強了，例如上海交大、大連海事大學等

3、這兩個專業都相對屬於不熱門的專業，相對來說水利水電工程還相對熱門一點

4、就業前景來說，水利水電工程的會寬一些而且單位多一些；港口航道與海岸工程就業方向更窄，但是行業門檻更高，能進去就很好，最好的出路就是進中交一二三四航道局了，不過這種單位很難進，全國就這4個航道局了，接下來就是去各種港口和碼頭了，這些有關係會好很多，不像水利的社會化招聘會更多一點

5、對將來發展都差不多，關鍵就是你進的單位，還有你個人能力的提升，這個最關鍵

前幾年還可以，雖然是冷門專業，但是畢業人數少，四大航務工程局就能消化，最近幾年水工市場持續萎縮，個人感覺行業前景不太好