迷你鸚鵡魚分公母的時候，可以根據它們的體色、生殖孔、背鰭、臀鰭、尾鰭等來區分。

看體色，公鸚鵡魚的顏色較紅，母鸚鵡魚顏色較淡，有的可能為較白的顏色。

還有就是看生殖孔部，公鸚鵡的生孔部官較平滑，母鸚鵡的生殖孔部較大，較突出。

1、公的鸚鵡體色比較紅，母的略淡，也容易變白。公鸚鵡魚背鰭、臀鰭略尖長，有時能超過尾鰭。母鸚鵡魚一般不超過尾鰭，明確區分公母有利於鸚鵡魚繁殖。

2、公鸚鵡魚比較好鬥，起頭的可能性略高。母鸚鵡魚在產卵前也會突然起頭(不是絕對的)。公鸚鵡魚看生殖孔部位比較平滑，突出部分很小。母鸚鵡魚生殖孔部位突出較大，明顯可見。

3、公鸚鵡魚腹部平滑，母鸚鵡魚略膨脹，到鄰近產卵時尤其如此。(這也需要區別品種，有的鸚鵡魚體型本來就圓，腹部也很圓，有的體型很長，即使是母的腹部也不圓，所以需要同品種間比較。)

4、它的雌雄鑑別和其他慈鯛科魚關一樣，可以輕易地根據背鰭長短加以區分，看生殖器。

迷你鸚鵡要到了4-5釐米左右才分得出公母。體型比公魚小一點，繁殖期到了肚子會變橙紅色，上下魚鰭不會超過尾巴，魚鰭尖比較圓潤，主要還是看肚子上的顏色最容易分出來母魚。

一，從體型上看，迷你鸚鵡魚種魚，母魚體型小巧，公魚健壯，體格大。跟孔雀魚正好相反。

二，觀察背鰭，迷你鸚鵡魚公魚背鰭纖長，如同拉著一條緞帶。母魚呢，背鰭圓潤。

三，發情期髮色位置。迷你鸚鵡魚公魚和母魚發情期髮色位置也不一樣，同時寶藍和白金也有所區別。迷你鸚鵡魚公魚發情期上色位置：體現在背鰭和尾鰭處，白金顏色較為紅豔，寶藍顏色近橘黃色。迷你鸚鵡母魚發情期上色位置：主要體現在母魚腹部，背鰭和尾鰭不明顯。寶藍母魚下腹處顯橘紅色，白金母魚整個下腹顏色較為紅豔

雄性白金迷你鸚鵡魚的體型細長，而雌性白金迷你鸚鵡魚的體型相對比較胖。根據魚尾來看，雄性白金迷你鸚鵡魚的魚尾寬而扁，而雌性白金迷你鸚鵡魚的魚尾壯而長。