1.總額預算。由保險機構和醫院協商的總預算額進行支付。在這個制度下，若是醫院的使用額度超過規定額度則虧損部分醫院自負。這種方式的優點是結算簡單，促使醫院採用最低成本提供一定量的醫療服務，但缺點是這個預算制定困難，難以做到精準預算。

2.按病種付費。透過統一的疾病診斷分類，科學地制定出每一種疾病的定額償付標準。社保機構按照該標準與住院人次向醫院支付費用，促使醫療資源利用標準化。

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3.按人頭付費。根據醫院提供的被保險人的總人數定期向醫院支付一筆費用。這種方式對醫院的服務和收入有控制作用，但也有可能因此導致醫院拒收疑難雜病病患者或服務質量降低的風險。

4.按服務單元付費。根據醫院提供的住院病人每日費用制定費用標準，再按照這個標準支付醫療保險費用。這種標準化費用保證了每一個住院病人的標準費用，但也會影響到醫療機構的服務質量或者拖延出院時間。

5.按服務專案付費。根據醫院每項服務的價格計算費用，所償付的費用取決於專案的費用和服務量。這個醫療保險費用支付方式簡單方便，患者也可以自行選擇，但容易出現誘導性和創造性需求。