該型別是按照農業生態系統的能量流動和物質迴圈規律構成的一種良性迴圈生態模式。

在該系統中一個環節的產出是另一個環節的投入，廢棄物在生產過程中得到多次利用，形成良性迴圈系統，從而獲得更高的資源利用率和最大經濟效益，並有效防止了廢棄物對農村環境的汙染。

該型別又可分為沼氣利用型、病蟲草防治型、產業鏈延長增殖型3種類型。

從農業生態系統的特點分，可以分為如下四種類型：

（1）立體農業生態系統。模擬天然生態系統的立體結構，設計建設具有立體層次的人工生態系統。由於立體農業生態系統比較充分地利用和轉化太陽能，因此提高了經濟效益，另外又增加了生態系統的穩定性，從而也提高了環境效益。立體農業的型別很多，主要有農作物的輪作、間作和套作，農林間作，茶膠間作，種植業與食用菌栽培相結合，農林牧相結合等。

物種共生的農業生態系統。將植物栽培與動物養殖有機地結合在同一空間，形成物種共生的生態系統，更充分地利用物質和能量，提高經濟效益和環境效益，以滿足人類的需要。物種共生的生態系統目前主要包括稻田養魚，蓮藕養魚，稻田養鴨，林蛙共生等型別。

（2）物質和能量多層次利用的農業生態系統。物質和能量的多層次利用，可以提高資源的利用率和經濟效益，還可以改善環境質量，其主要型別有基塘生態系統。基塘型別有桑基魚塘、果基魚塘、花基魚塘。其它如種植業與養殖業結合的生態系統，以及以沼氣為紐帶的物質多層次利用系統。

（3）多功能農工聯營生態系統。綜合利用農業生態學的理論和方法，實行種植業、養殖業、加工業三者密切結合，建立多功能 的農工聯營生態系統，其生態效益、經濟效益和社會效益都很明顯，而且也很協調。主要型別有農、林、牧、漁全面發展的農工聯營生態系統，以林、特產為主的農工聯營生態系統，以水產養殖為主的農工聯營生態系統，以糧食加工為主的農工聯營生態系統。

從自然不同生態條件和經濟發展水平形成如下四種類型：

（1）生態脆弱區生態農業縣的發展模式。主要在黃河中上游地區、長江上中游和三北風沙地區及其它以山區、高原為主的自然經濟條件較差的縣域。這類生態農業縣建設的基本模式為“治理與結構最佳化性”。主要途徑為對惡化的生態環境進行治理，重點是植被恢復；加強農業基礎設施建設，重點是基本農田建設；對農業生產結構進行最佳化調整，重點是以提高糧食單產為出發點，壓縮糧田面積，適度擴大林果牧業，實現農林牧綜合發展。

（2）生態資源優勢區生態農業縣的發展模式。主要分佈在南方交通不便，但生態與資源、環境良好的經濟不發達地區。這類地區以南方較好的山地丘陵為主，發展生態農業的主要模式為“生態保護與生態產業開發型”。主要途徑為切實保護生態環境和自然資源，保護生態優勢；加強農業基礎設施建設；大力開發生態型特色產品，發展生態產業。

（3）農業主產區生態農業縣的發展模式