登出流程：

1、申請人登入原發證的食品藥品監督管理部門申報端或省級食品經營許可管理系統（網上申請），填寫《食品經營許可登出申請書》並附相關申請材料。

2、申請人向原發證的食品藥品監督管理部門提交申請資料，材料齊全、符合法定形式的，予以受理；

申請材料存在可以當場更正的錯誤的，允許申請人當場更正；申請材料不齊全或者不符合法定形式的，應當場或者在五個工作日內一次性告知申請人需要補正的全部內容。

3、符合條件的，依法作出准予許可的書面決定；不符合條件的依法作出不予許可的書面決定，在說明理由的同時，告之申請人享有依法申請行政複議或提起行政訴訟的權利。

4、申請人到原發證的食品藥品監督管理部門食品藥品監管局視窗領取《准予登出通知書》或不予登出決定書。

補辦食品經營許可證的，如果在未辦理食品經營證的情況下有經營食品的行為，可能會被處以罰款。根據中國《食品經營許可管理辦法》規定，未取得食品經營許可從事食品經營活動的，由縣級以上地方食品藥品監督管理部門依照《中華人民共和國食品安全法》第一百二十二條的規定給予處罰。