線上粒體基質中進行,因為在這個迴圈中幾個主要的中間代謝物是含有三個羧基的有機酸,所以叫做三羧酸迴圈；有由於器中第一個生成物是檸檬酸,因此又稱為檸檬酸迴圈；或者以發現者Hans Krebs命名為Krebs迴圈.反應過程的酶,除了琥珀酸脫氫酶是定位於線粒體內膜外,其餘均位於線粒體基質中

主要事件順序為：

（1）乙醯CoA與草醯乙酸結合,生成六碳的檸檬酸,放出CoA.檸檬酸合成酶.

（2）檸檬酸先失去一個H2O而成順烏頭酸,再結合一個H2O轉化為異檸檬酸.順烏頭酸酶

（3）異檸檬酸發生脫氫、脫羧反應,生成5碳的a-酮戊二酸,放出一個CO2,生成一個NADH+H+. 異檸檬酸脫氫酶

（4） a-酮戊二酸發生脫氫、脫羧反應,並和CoA結合,生成含高能硫鍵的4碳琥珀醯CoA,放出一個CO2,生成一個NADH+H+. 酮戊二酸脫氫酶

（5）碳琥珀醯CoA脫去CoA和高能硫鍵,放出的能透過GTP轉入ATP琥珀醯輔酶A合成酶

（6）琥珀酸脫氫生成延胡索酸,生成1分子FADH2,琥珀酸脫氫酶

（7）延胡索酸和水化合而成蘋果酸.延胡索酸酶

（8）蘋果酸氧化脫氫,生成草酸乙酸,生成1分子NADH+H+.蘋果酸脫氫酶

小結：

一次迴圈,消耗一個2碳的乙醯CoA,共釋放2分子CO2,8個H,其中四個來自乙醯CoA,另四個來自H2O,3個NADH+H+,1FADH2.此外,還生成一分子ATP.

1.三大營養素的最終代謝通路:糖、脂肪和蛋白質在分解代謝過程都先生成乙醯輔酶A,乙醯輔酶A與草醯乙酸結合進入三羧酸迴圈而徹底氧化。所以三羧酸迴圈是糖、脂肪和蛋白質分解的共同通路。

2.

糖、脂肪和氨基酸代謝的聯絡通路:三羧酸迴圈另一重要功能是為其他合成代謝提供小分子前體。α-酮戊二酸和草醯乙酸分別是合成穀氨酸和天冬氨酸的前體;草醯乙酸先轉變成丙酮酸再合成丙氨酸

在絕大多數生物體內，糖、脂肪、蛋白質、氨基酸等營養物質，都必須透過三羧酸迴圈進行分解代謝，提供能量。所以它是糖、脂肪、蛋白質、氨基酸等物質的共同分解途徑。另一方面三羧酸迴圈中的許多中間體如α-酮戊二酸、琥珀酸、延胡索酸、蘋果酸、草醯乙酸等又是生物體進行物質合成的前體。所以三羧酸迴圈具有分解代謝和合成代謝的雙重作用。