一、兩者的含義不同：

1、直管公房的含義：直管房是指由國家各級房地產管理部門管理的國有房產，還包括計劃經濟時代國有和大集體企事業單位自建的福利房。

2、公租房的含義：公共租賃住房是指由國家提供政策支援、限定建設標準和租金水平，面向符合規定條件的城鎮中等偏下收入住房困難家庭、新進就業無房職工和在城鎮穩定就業的外來務工人員出租的保障性住房。

二、兩者的性質不同：

1、直管公房的性質：國家房地產管理部門享有所有權的或直接經營管理的房屋，稱直管房屋。管理形式表現為某市某區的某個房產經營管理所，簡稱房管所。

2、公租房的性質：公共租賃住房不是歸個人所有，而是由政府或公共機構所有，用低於市場價或者承租者承受起的價格，向新就業職工出租，包括一些新的大學畢業生，包括一些退休老人及殘疾人。還有一些從外地遷移到城市工作的群體。

三、兩者的管理不同：

1、直管公房的管理：持公房使用權上市交易一方當事人應當是公有住房合法承租人。公房使用權交易前，當事人雙方應當簽訂書面協議，協議簽訂後，當事人雙方持相關材料到房屋所在地直管公房經營管理單位辦理公房使用權互換、轉讓、轉租手續。

相關材料包括申請書；雙方當事人身份證明；公有住房租賃合同及共居人、合居戶同意意見書；房屋所有權證和共有人同意意見書。當事人因故不能親自辦理相關手續的，可以委託他人代為辦理。受委託人應當提交當事人出具的授權委託書。

以公房使用權交換住房產權，當事人雙方須按規定到房地產行政主管部門辦理交易及產權變更登記手續。除按照北京市住房制度改革有關規定可以向承租人出售的公有住房外，包括平房、筒子樓、簡易樓等其它直管公有住房均可上市進行交易。

2、公租房的管理：公共租賃住房供應物件主要是城市中等偏下收入住房困難家庭。有條件的地區，可以將新就業職工和有穩定職業並在城市居住一定年限的外來務工人員納入供應範圍。

公共租賃住房租金水平，由市、縣人民政府統籌考慮住房市場租金水平和供應物件的支付能力等因素合理確定，並按年度實行動態調整。符合廉租住房保障條件的家庭承租公共租賃住房的，可以申請廉租住房租賃補貼。

公共租賃住房出租人與承租人應當簽訂書面租賃合同。公共租賃住房租賃合同期限一般為3至5年，合同示範文字由省、自治區、直轄市住房城鄉建設（住房保障）部門制訂。承租人應當按照合同約定合理使用住房，及時繳納租金和其他費用。租賃合同期滿後承租人仍符合規定條件的，可以申請續租。

公共租賃住房只能用於承租人自住，不得出借、轉租或閒置，也不得用於從事其他經營活動。承租人違反規定使用公共租賃住房的，應當責令退出。承租人購買、受贈、繼承或者租賃其他住房的，應當退出。對承租人拖欠租金和其他費用的，可以通報其所在單位，從其工資收入中直接劃扣。