熱帶雨林系統中，土壤貧瘠的根本原因是：(1)有機質分解和養分再迴圈旺盛，土壤缺少養分積累和補充。(2)高溫多雨的氣候，地表徑流和淋溶作用強。因此土壤很貧瘠。 一般熱帶雨林裡的土壤，在高溫多雨的影響下， 過量的雨水，會帶來強烈的淋溶作用，可溶解並帶走差不多所有可溶解的礦物，如鉀、鈉、鎂、鈣等的鹽基，使土壤失去植物所需的養分而變得貧瘠。 另一方面，那些不易溶解的礦物，相對地集中起來。最常見的殘留礦物為鐵氧化物，使土壤顏色偏紅，因而被人們稱為磚紅壤；另一種常見的殘留礦物為鋁氧化物，特別是鋁礬土，通常會使土壤顏色偏白。這些礦物甚至會膠結在一起，形成不透水的硬碟。 一般熱帶雨林系統中的土壤結構，土壤之上為枯枝落葉層，但完全分解而形成的黑色腐殖質卻不多。 其下為土壤的表層，以淋溶作用為主。不但會使可溶礦物盡失，就是泥土顆粒也容易被分解或沖走，只殘留下鐵或鋁的氧化物。這就是造成熱帶雨林系統中，土壤貧瘠的主要原因。

熱帶雨林系統中，土壤貧瘠的根本原因是：(1)有機質分解和養分再迴圈旺盛，土壤缺少養分積累和補充。(2)高溫多雨的氣候，地表徑流和淋溶作用強。因此土壤很貧瘠。

主要是因為熱帶雨林高溫多雨，土壤風化作用和雨蝕作用強烈，形成較厚的土壤層。形成土壤的過程也很快。

熱帶雨林土壤層雖然厚，但十分貧瘠，營養物質集中在表層土壤中，中下層土壤嚴重缺乏營養物質。由於溫度高、水分充足，微生物、土壤動物對有機質（枯枝落葉等）的分解速度非常快，植物可以吸收到大量的速效的溶解態的營養物質，植物長的好。

但由於植物在表層土壤中就能夠吸收到充足的營養，使大多數植物的根系較淺，深層土壤有機質含量低，土壤貧瘠。一旦雨林植被受到破壞，土壤裸露，則會造成水土流失，表層土壤中的營養物質迅速減少，生態難以恢復。