1.將染色劑直接浸入瑪瑙，然後進行加熱分解，氧化或還原，生成呈色的氧化物。如要將瑪瑙染成蘋果綠色可用硝酸鎳溶液浸泡瑪瑙，然後加熱，生成的氧化鎳呈綠色。

2.將兩種可以起化學反應生成著色劑的化學試劑，先後分兩次浸入瑪瑙，生成的著色劑經熱處理可以分解成呈色氧化物或簡單化合物。例如，染藍綠色的方法，重鉻酸鉀與碳酸銨反應生成的重鉻酸銨加熱分解生成的三氧化二鉻呈色。

3.先將一種著色劑浸入瑪瑙內部，然後再用一種固色劑浸泡，讓著色劑與固色劑反應產生一種難溶呈色化合物，而使瑪瑙著色。這種方法不需要高溫加熱，生成的沉澱要求穩定性好。

一，瑪瑙染色有兩種方法，其一為蜂蜜染色法，即將瑪瑙泡在蜂蜜中，取出後放在火上烤，進入瑪瑙的蜂蜜烤成炭而使瑪瑙變黑，但用這種方法染黑在透射光下看是褐色的，不太黑。其二為化學染色法，將瑪瑙浸泡在含有某種著色物質組分的化學試劑溶液中，使化學組分滲入到瑪瑙的孔道中，然後再投入到某一種化學試劑中，產生某種化學反應，在孔道中沉澱出不溶於水的有色物質，或者加熱瑪瑙使孔道中的化學試劑分解，形成不溶於水的有色氧化物，從而使瑪瑙顏色發生改變。二，古老的方法對人體無害，但是幾乎不會採用；一般瑪瑙染色多用化學方法，科學研究表明對人體無害。三，不過依賴科技作為判定標準的一個問題就是科技會有新發展，可能現在對人體無害，但不保證以後科學研究不會推翻這一結論。

　　瑪瑙化學染色的原理是：　　將瑪瑙浸泡在含有某種著色物質組分的化學試劑溶液中，使化學組分滲入到瑪瑙的孔道中，然後再投入到某一種化學試劑中，產生某種化學反應，在孔道中沉澱出不溶於水的有色物質，或者加熱瑪瑙使孔道中的化學試劑分解，形成不溶於水的有色氧化物，從而使瑪瑙顏色發生改變，獲得漂亮的顏色。瑪瑙化學染色的方法一般有兩種，一是用可溶性的可著色金屬鹽溶液浸泡瑪瑙，讓試劑組分充分滲入到瑪瑙的孔道中，然後熱瑪瑙，使孔道中的化學試劑分解成不溶於水的有色氧化物，例如：將重鉻酸銨{（NH4）2Cr2O2}試劑溶解於水，把瑪瑙浸泡其中，當重鉻酸銨組分己經滲入到瑪瑙內部的孔道之中後，取出瑪瑙緩慢加熱至300攝氏度，重鉻酸銨分解成不溶於水的三氧化二鉻而成綠色。二是把瑪瑙浸泡在一種化學試劑溶液中，待化學試劑組分滲入到瑪瑙孔道中以後取出，放入另外一種化學試劑中浸泡，後一種化學試劑在滲入瑪瑙孔道的過程中，與第一種化學試劑發生化學反應，形成難溶於水的有色沉澱，這種方法最好在以後的加工工序中表面塗蠟。封住瑪瑙的孔道，例如：讓瑪瑙染成普魯士蘭色時，可以先將瑪瑙浸泡在亞鐵氰化鉀溶液中浸泡，就可以得到漂亮的，難溶於水的普魯士蘭色瑪瑙。