《包青天再起風雲》的結局是公孫策在山崖旁邊尋找消失的雲千羽。展昭追查包拯父母下落，但是飛揚卻拒絕透露相關的事情，包拯指出千羽在出嫁時遇到了危險，公孫策四出尋覓千羽，神秘女子聲稱能尋找到亡魂還可幫助包拯再遇念念，包拯在戶外甦醒後卻被指曾大開殺戒，念念出現還突然向包拯施襲。

從後期發展的劇情來看，大BOSS也就是雲中流，從一開始就已經登場，原來看起來像是“正義之士”的他，竟是皇室宗親，為了當上皇帝，不惜犧牲掉自己身邊的人，只為完成他眼中的“大業”。

故事的最後，正常的發展便是雲中流領盒飯，TVB依舊秉承“好人有好報，惡人得到應有下場”的結局，前半部分的結局還是構造得蠻好的。但是接下來的劇情，就讓觀眾一頭霧水了。

宋仁宗年間，包拯上任開封府尹，與幕僚公孫策、侍衛展昭、四捕快合力打擊歪風。商人之女雲千羽能言善辯，得公孫策指點成為訟師；高昌婢女紀念念精通驗屍，二女同助開封七子屢破奇案。然而，開封府內危機四伏。龐太師專橫霸道，多次加害包拯。包拯跟念念志趣相投，情愫漸生，卻發現其真正身份暗藏重大陰謀……千羽的父親雲中流心懷異志，更力指仁宗並非真龍天子！包拯面對最難審判的案件，到底會為社稷而埋沒良心，還是揭露真相？

雖說古代女子地位普遍較低，但好男人不會如此。包大人熟讀經義，在人倫方面自然也會有遵從自然的想法。從而，有人人平等的思考。這摒棄了對女子的偏見。共同生活，夫妻感情深厚，為了更好的生活，不能去做官，太沒自由的時間

一共有八個案件，色字頭上一把刀，花蝴蝶案，郎心如鐵，逆天奇案，Murano傳說，狸貓換太子，夜半鬼敲盤，天火焚城。