魚缸過濾棉正確的擺放也是有一定順序的。我們可以按照以下順序來擺放過濾棉。首先在最上層，我們可以擺放羊絨棉。其次，在羊絨棉的下方，為了保證流水通暢，我們可以擺放一層堵水剋星。堵水剋星的下方，我們可以再擺放一層普通白棉。白棉的密度較高，可以有效的過濾各種雜質。白棉的下方，我們可以擺放一塊生化棉。

順序如下：

1.第一級：物理過濾級：放置纖維棉。

2.第二級：化學過濾級：放置活性炭、吸氨石、沸石、清水樹脂等化學性吸附濾材。

3.第三級：生物過濾第一級：放置生化棉。

4.第四級：生物過濾第二級：放置生化球。

5.第五級：生物過濾第三級：放置瓷環。

6.第六級：生物過濾第四級：放置黃化煤或水草砂。

7.第七級：水平衡槽：放置纖維棉以及潛水泵將已過濾後的水輸送回魚缸。

放過濾棉和濾材的順序是這樣，進水口最靠近的，放物理過濾棉，接著是生化過濾棉，最後才是濾材。因為出水口的最髒，先物理過濾掉，也方便清洗，然後順著下去一些水中的物質剛好經過濾材，也就是經過硝化菌來處理。看下圖。