明朝末年，武當派數位高手相繼遇害。時隔多年，兇手仍然是個謎。當昔日遺孤，當俗家弟子耿玉京已長成翩翩少年時，與前來比武的東方亮不打不相識，成為了無話不談的摯友。倏忽間，風雲再起，先是泰昌帝服用武當紅丸後暴斃，後是新任武當掌門又對耿玉京步步相逼。無奈之下，耿玉京離開了武當山，在“獨行大盜”鄭鐵崗和其孫女鄭巧兒的幫助下，秘密追查當年父母遇害的真相……在追查事情的過程中，他又先後遇到了少林僧人慧可、斷魂谷谷主盧象升、崑崙西門燕等武林人士，最後還與遼東的努爾哈赤成為了忘年之交。當調查逐漸有了指向，昔年隱藏的真相逐漸顯露端倪時，耿玉京終於發現了努爾哈赤鯨吞中原的野心，而自己的父母當初便是因此而被害。帶著國仇和家恨，耿玉京、東方亮一行回到了武當，自此埋藏多年的謎案終於揭曉，內奸也受到了應有的懲罰。

武當一劍》的故事，主要是說男主角耿玉京這位“武當一劍”的傳奇故事。耿玉京一路行來，發現了自己的身世，也發現幕後黑手是武當掌門身邊的聾啞道人王晦聞。最終，耿玉京報仇雪恨，則與戀人“西門燕”前往關東行俠仗義，甚至刺殺了努爾哈赤，成為享譽江湖的“武當一劍”

耿玉京受西門夫人臨終之託，帶著愛侶西門燕赴關東行俠，並於數年後在戰場上刺殺了努爾哈切，打擊了後金勢力，東方亮得到武當劍法心法，遊俠江湖，而牟一羽則成了新的武當掌門，使到武當派欣欣向榮。

《武當一劍》人物結局介紹，無相，武當掌門坐化。卓一航，武當大弟子歸隱。練霓裳，綠林總瓢把退出江湖。。。。。

耿玉京直接用武當一劍，將不聞給殺了。

武當山金頂之上，耿玉京、東方亮、郭璞和不聞、無量、金鼎和“六大頂尖高手”齊聚 ，不聞和無量正在揭示自己過去所做的惡事，一場終極大戰在即。

黑衣人不聞終於說出了一切，原來他就是當年的“小五義”王晦聞。郭璞跟不聞打了起來，為郭東來報仇，不聞打傷了郭璞，為自己即將改變小五義的排名而洋洋得意，沒想到這時東方亮出現了。不聞打不過東方亮，因為有金蠶絲斗篷護體，東方亮一直傷不到他，所以他在耿玉京也趕來時，趁機逃離武當了。不久後，大明皇帝重新下詔，封武當為國教。武當事了之後，耿玉京和鄭巧兒拜別了所有人，一路趕去遼東，想要取了不聞的性命，沒想到卻在遼東看到努爾哈赤準備向山海關邁進了。

耿玉京在努爾哈赤集結隊伍時出現，努爾哈赤先是恭喜耿玉京武功大成，然後便把不聞是他的兄弟的事情說出來，想要保不聞性命。耿玉京不管努爾哈赤，他堅持要取不聞的性命，不聞也只能與耿玉京一戰。

耿玉京直接用武當一劍，將不聞給殺了，結束了他們所有的恩怨，也沒有讓不聞感到特別的痛苦，算是償還不聞這些年對他的疼愛之情。