幼苗長至3至4片真葉時，根系開始擴大，吸水能力逐漸增強，澆水次數要逐漸減少。

使畦面見幹見溼，以促進根系的發育和加速幼葉分化。若澆水過多，易導致幼苗徒長，不利於培育壯苗。在2至3片真葉以後，可結合澆水進行2至3次追肥，追肥量要掌握“少量多餐”的原則。一般每個 育苗畦衝施尿素或三元複合肥0.25至0.5千克。根據苗情，在苗期還可結合防治蚜蟲施1至2次葉面肥。

一般來說，剛出苗的芹菜幼苗可不用著急施肥，因為播種時已經施有底肥，此時把握好澆水問題就好了。當芹菜長至5釐米高時就可施肥，應施氮肥、磷肥，可每畝12~15公斤尿素或複合肥，以水融化後進行噴施。不能直接淋施，否則會造成幼苗倒伏。之後，每5~7天施肥一次。也可根據天氣情況而進行施肥澆水配合進行，適當縮短或延長施肥時間。少量多施，是最適合的方式。

芹菜應以速效性氮肥為主，並注意磷、鉀肥和生物有機肥的配合應用，做到輕肥勤施，小水常澆。

出苗後10天左右追施一次速效性稀薄氮肥，當長出3～4片真葉時可追施一次磷鈣肥。