在本科上普通微生物實驗課時專門有一次是分離土壤微生物的課。土壤微生物有細菌、真菌、放線菌。土壤微生物種類繁多，但根據地區的不同又有很強的地域特性。這是因為經過某個地區的自然環境選擇，微生物自然演化就形成了適宜在該地區生長生活的群落，比如金礦產地周圍可以分離到可以消化金的菌株，可以用來鍊金。此外微生物可以生成所有有機產品，微生物還可以透過突變實現增高產量，因此土壤微生物育種給我們生活帶來很大影響，不僅僅是發酵類食品，還有各種藥物。最近獲諾貝爾獎的阿維菌素也是最先從日本靜岡縣土壤分離得到的。

土壤中的有機物可以透過土壤生物分解成無機物。

植物把無機物合成為有機物，但是植物本身不能直接利用土壤中的有機物，而只能吸收土壤中的無機物。因此，微生物的作用和植物正好相反，把有機物分解物植物可以吸收利用的無機物。

腐殖質不是一類物質，只是對微生物分解一些動植物殘骸等後和土壤混合在一起形成的混合物的一種稱謂。

少數是分解者。

分解者：

是生態系統中將死亡的動植物的遺體分解的微生物。分解者把動植物遺體或殘落物中的複雜的有機物分解成簡單的無機物(如水、無機鹽和，氧化碳等)。這些物質又可以被綠色植物吸收和利用，在生態系統中促進了物質迴圈和能量流動，所以分解者是生態系統中不可缺少的組成部分。

分解者主要是指細菌菌和真菌。並不是所有的植物都是生產者，也有少數屬於消費者，如菟絲子纏繞在大豆上，營寄生生活；動物大部分是消費者，但有的動物也起到了分解者的作用，如蚯蚓、蜣螂等腐生動物。

分解者是生態系統中將動植物遺體和動物的排遺物等所含的有機物質轉換為簡單的無機物的生物。

主要包括營腐生生活的細菌、真菌，及原生動物、小型無脊椎動物等異養生物。

昆蟲一般是消費者 把有機物轉化成無機物