金色葡萄球菌呈球形，直徑0.48微米，排列成葡萄串狀，無鞭毛，無芽孢，多數無莢膜。金葡菌的細胞壁有大量磷壁酸構成該菌的表面抗原，透過共價鍵與粘肽層的胞壁酸相連，在細胞膜的外面尚有膜磷壁酸，對維持胞膜穩定性和胞膜酶的啟用都具有重要意義，胞壁可耐25個大氣壓。

金葡菌的噬菌體分型特異性不高，因為多數菌株能與兩種以上噬菌體起反應。

金黃色葡萄球菌為球型，革蘭氏染色陽性。金黃色葡萄球菌營養要求不高，在普通培養基上生長良好，需氧或兼性厭氧，最適生長溫度37°C，最適生長pH 7.4,乾燥環境下可存活數週。

血平板菌落周圍形成透明的溶血環。金黃色葡萄球菌有高度的耐鹽性，可在10~15%NaCl肉湯中生長。金黃色葡萄球菌具有較強的抵抗力，對磺胺類藥物敏感性低，但對青黴素、紅黴素等高度敏感。

金黃色葡萄球菌在普通培養基上形成圓形隆起。表面光滑溼潤，邊緣整齊，不透明，中等大小的菌落，因菌株不同，產生不同顏色的脂溶性色素而使菌落呈金黃色，白色，檸檬色。在血平板上，多數致病菌株可以形成透明溶血環。