新農合出院報銷是有時間限制的，要求在出院10日內辦理報銷手續。一般情況下，應該是醫院結算串鉤直接結算的。具體如下：

1、參合農民在縣內定點醫療機構就診，不需辦理轉診手續；

2、轉診到縣外定點醫療機構就診者，須持縣級定點醫療機構的診斷和轉診證明報縣合管辦審批；

3、經批准登記並在出院10日內持有關證件到縣合管辦按照市級或市級以外就診執行補助，否則不予補助。

4、為照顧到部分參合農民在縣外就診後因跨年度的原因不能及時按照要求返回縣內進行補償，這些縣每年都會將跨年度補償的時間延後至本年度的2月底。【法律依據】 《中華人民共和國社會保險法》第二十八條，符合基本醫療保險藥品目錄、診療專案、醫療服務設施標準以及急診、搶救的醫療費用，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。

農村合作醫療保險報銷時間是1年。也就是報銷本年度內的醫療費用。不過定點報銷的地方一般要求3個月內報銷，有特殊情況可以延長至6個月。

農村合作醫療保險，是指由政府組織、引導、支援，農民自願參加，個人、集體和政府多方籌資，以大病統籌為主的農民醫療互助共濟制度。採取個人繳費、集體扶持和政府資助的方式籌集資金。農村合作醫療是由中國農民自己創造的互助共濟的醫療保障制度，在保障農民獲得基本衛生服務、緩解農民因病致貧和因病返貧方面發揮了重要的作用

合作醫療出院時就可以報銷，直接醫院報銷了，但在處省住院的，有些地方要自己拿單據去報銷的，農村合作醫療報銷有期限，參保人需要在就診結束後當前年度申請，跨年度則不予報銷，如果是年底就診需跨年度報銷的也不能超過2個月。

因為農村合作醫療保障期限為一年，第二年需重新籌資，參保人需要重新繳費參合，而且第二年的報銷方案也可能會改變。

一般來說出院就可以報銷的，如果是春節前的話，就要等到過年後一個月就可以報銷了。

合作醫療報銷主要有以下幾種方法：

1.本地醫療卡直接在辦理出院手續結賬時刷卡結算；

2.異地醫療，出院後攜帶相關證件去報銷；

3.特殊病種門診報銷，出具相關檢查報告資料以及《新農合特殊病種門診治療審批表》向新農合業管中心提出申請。