原因有好幾個，第一，宇智波一族是木葉的開拓者之一，不管是為了面子還是什麼都得保留一下，面子工程得做；第二，宇智波鼬和木葉上層有交易，鼬負責傳遞曉組織的情報，木葉負責保護佐助；第三，宇智波一族的血繼限界稀有，不能外流；第四，鳴人看上的基友，小櫻的暗戀物件；第五，所謂木葉的意志，不拋棄，不放棄；第六，劇情需要；

TV版110集 小櫻在村口求鳴人一定要把佐助帶回來 鳴人許下約定

大蛇丸企圖用佐助作為下一個容器，卻諷刺性地在自己進行轉生的結界內，被佐助反吞噬及奪去一切力量。

後師兜把其剩下的遺體移植到自己的左手，欲得到大蛇丸的能力，不過也被大蛇丸遺體反吞噬已達3成。於392話中，大蛇丸潛藏在佐助的查克拉，因佐助本身力量耗盡而被釋放出來，大蛇丸亦因此一度控制佐助，幻化出八歧大蛇。但最終仍為宇智波鼬的絕招‘須佐能乎’所剋制，大蛇丸連同八歧大蛇被吸進酒葫蘆的空間內，此後佐助的咒印消失了。