在鵪鶉剛出殼的24小時內，可以進行翻肛鑑別，具體方法是：用左手將雛鶉的頭朝下，背緊貼手掌心，並輕握著；再用左手的拇指、食指和中指捏住鶉體，然後用右手的食指和拇指將雛鶉的洩殖腔上下輕輕撥開；若洩殖腔的粘膜呈黃赤色且下面的中央有一小的生殖突，則就是雄性；反之，若呈淡黑色且無生殖突，則為雌性。

鵪鶉的受精率受多種因素的影響，公母比例是其中重要因素。鵪鶉公母配種比例適當,可以保證高的受精率。如母鵪鶉過多，易造成漏配;而公鵪鶉過多，則產生爭配現象，都會降低種蛋的受精率。鵪鶉的公母比例與品種、日齡等有關係。目前採用的公母比例如下:北韓龍城鵪鶉為1:2.5-1:1.5;法國肉鵪鶉為1:2-1:3;白羽鵪鶉為1:3-1:6如果種公鵪鶇年輕、體質強,則與之交配的母鵪鶉數可酌情增加。受精率很低的公鵪鶉要及時淘汰,並隨時補充因淘汰而出現的缺額數。

區分：

1、公鵪鶉體形緊密，體重比較小；母鵪鶉體形寬暢 ，體重比較大。

2、公鵪鶉的胸部和麵頰的地方羽毛時紅褐色；母鵪鶉的胸部和麵頰的地方羽毛是灰色帶黑色斑點的。

3、普通鵪鶉雄性成鳥（夏羽）：額部幾全為慄黃色頭頂、枕部和後頸黑褐色，羽端深慄黃色；中央具一條狹窄的白色冠紋。母鵪鶉的肛門上方部位偏小。