國家藥品編號是指在藥品研製、生產、經營、使用和監督管理中由計算機使用的表示特定資訊的編碼標識。

國家藥品編號以數字或數字與字母組合形式表現，國家藥品編碼遵循科學性、實用性、規範性、完整性與可操作性的原則，同時兼顧擴充套件性與可維護性。

國家食品藥品監督管理局成立之前，藥品標準由衛生部負責制訂，標準號為WS（衛生）開頭，待標準轉正後，在WS後加注下標，其中WS1、WS2、WS3分別表示化藥、生物製品和中藥，並在藥品標準末尾加註年份和字母Z，表示該標準已轉正及轉正時間。

標準轉正後，原標準即停止使用。國家食品藥品監督管理局成立之後，並未廢止上述標準號，並在一段時間內沿用了衛生部標準的編號原則。

從2003年下半年開始，SFDA逐漸用新的標準命名原則來取代，但尚未檢索到國家食品藥品監督管理局正式行文通報新的標準命名原則。

新的標準號以YB（藥品標準）開頭，其中YBH、YBS、YBZ、YBB分別表示化學藥品標準，生物製品標準，中藥標準和包材標準，標準號沒有表示轉正的標記。