DNA顯色的原理：利用一些顯色劑與所檢測物質中一些特殊基團特異性結合的特徵,透過顯色劑在細胞中的定位及顏色的深淺來判斷某衝物質在細胞中的分佈和含量。核酸是由喊基、糖苷及磷酸基團組成的。當組織細胞中的核酸經過1.0N HCl處理後,大多RNA分子斷裂並從細胞中脫落下來,而DNA分子中鹼基與核酸脫離,核酸被水解形成帶遊離醛基的結構核酸上的醛基可與Schif試劑結合而顯色,故Feulgen染色是對DNA的特異性染色。

DNA顯色的原理：DNA 在酸性條件下加熱，其嘌呤鹼與脫氧核糖間的糖苷鍵斷裂，生成嘌呤鹼、脫氧核糖和脫氧嘧啶核苷酸，而2-脫氧核糖在酸性環境中加熱脫水生成ω-羥基-γ-酮基戊糖，與二苯胺試劑反應生成藍色物質，在595nm 波長處有最大吸收。DNA 在40-400μg 範圍內，光吸收與DNA的濃度成正比。在反應液中加入少量乙醛，可以提高反應靈敏度。

DNA銀染的基本原理是先用固定液將核酸固定到凝膠上，然後使銀染液中的銀離子與之牢固結合，再透過還原劑將銀離子還原，從而發生了顯色反應，使得目標產物能夠憑肉眼即能看見。

銀染法對試劑的要求相對不高， 一般中國產分析 純試劑即可滿足要求，並且固定液和染色液可以重複使用，降低了實驗成本， 銀染後的凝膠可以長期儲存，更有利於對實驗結果的回顧性分析。在目前的分子生物學研究上具有廣泛的推廣價值。