光合細菌必須有光，硝化細菌不需要光，但也不怕光，應該可以一起用

若要同時施用不同的淨水製劑，應該注意製劑之間的共容性。如：硝化細菌和光合細菌並不適合同時投放在同一養殖池塘中，因為它們淨化水質的過程相互有抑制作用，會降低其使用效果。

光合細菌是活體細菌，藥物對其具有殺滅作用，因此，不可與抗生素及消毒殺菌劑同時使用。一般在水體消毒7d後使用，否則會影響其使用效果。

光合作用和化能作用（硝化作用）都是自養的方式。不同點有

第一，直接能源不同，這是最大的不同，光合作用的直接能源是光能，而硝化作用的直接能源是化學能，雖然二者都可以將這些能量據為己用合成有機物，但由於直接能源不同，所以所需要的酶也是很不一樣的。

第二，光合作用比硝化作用有著更普遍的存在，因為光隨處可見切來源廣泛，而硝化作用所需的氨在自然界存在的量並不是很大。

第三，光合作用是高等綠色植物以及一些光合細菌才具有的，硝化作用只有硝化細菌才具有。

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