過濾棉清洗次數以魚缸負荷量為依據， 如果密度大或者大型魚佔主導，建議3天以洗，如果密度小或者小型魚佔主題，一週一洗就可以。

最好是一個月換一次，每隔一個星期進行定期的清理。但是如果是聚酯泡沫材料過濾棉可以3個月更換一次。由於過濾棉是培養硝化細菌的場所，是不能進行經常清理的，一般一個星期清理一次是最好的。清洗過濾棉的時候，不能直接使用自來水，要使用魚缸中的水。在清洗的過程中，如果發現濾棉的厚度變得越來越薄，就說明它過濾水的效能變差了，這時就可以考慮換濾棉了。

魚缸生化棉一星期換一次就可以。生化棉更換的時間可以根據材質判斷，如果是合成纖維，一次需要約一個月左右；聚酯泡沫的材料一次大約3個月；生物棉換6個月左右的時間。每次洗的時候都要檢查是否變薄，過濾水的質量是否變差，如果有的話就討論交換吧。也可以根據過濾棉花多久交換來判斷密度。

過濾棉更換時間可以根據材質來判斷，如果是合成纖維，一次約需一個月左右；聚酯泡沫材料一次約3個月；生化棉料6個月左右改變時間。