生物的進化實質上就是種群基因頻率發生變化的過程。

基因頻率是指某種基因在某個種群中出現的比例。基因頻率可用抽樣調查的方法來獲得。如果在種群足夠大，沒有基因突變，生存空間和食物都無限的條件下，即沒有生存壓力，種群內個體之間的交配又是隨機的情況下，種群中的基因頻率是不變的。

但這種條件在自然狀態下是不存在的，即使在實驗條件下也很難做到。實際情況是由於存在基因突變、基因重組和自然選擇等因素，種群的基因頻率總是在不斷變化的。

這種基因頻率變化的方向是由自然選擇決定的。所以生物的進化實質上就是種群基因頻率發生變化的過程。

基因頻率和種群基因頻率是一回事兒。我們一般情況下把種群基因頻率就說成是基因頻率。在一個種群基因庫中，某個基因佔全部等位基因數的比率。叫做基因頻率。所以他們兩個是一個意思。

都是描述種群數量特徵或單位空間數量或單位時間內數量特徵的指標。

研究種群數量特徵是確定種群結構輪廓、種群與生存環境系統時空範圍（規模）的最基本的性質之一。

種群結構、種群與環境構成的生態系統範圍是認識生態系統功能（價值）的基礎資訊。