一是害蟲，二是病害，常常是混合發生危害。具體原因有以下幾點。

(1)核桃舉肢蛾的危害。每年的6月中旬，小麥成熟開鐮收割時，初孵化的幼蟲就會鑽入核桃青皮內取食，早期為害可以造成核桃黑皮脫落，後期會造成核桃黑皮果仁乾癟。7月危害最嚴重。

(2)核桃果象甲的危害。每年的5月中旬幼蟲鑽入核桃青皮內為害果仁，導致果實變黑脫落。

(3)核桃炭疽病的危害。發病高峰期在每年的6—8月，核桃受害後，果皮上可出現圓形褐色或黑褐色病斑，病斑中央凹陷且有小黑點。發生嚴重後病斑連片，使果實變黑腐爛，早期危害後造成落果，遇到降雨多、溼度大、氣溫 高、樹勢弱、通風差的果園，該病發生早而且嚴重。病菌靠風雨和昆蟲傳播，易從傷口和蟲害危害處侵入。

(4)核桃黑斑病的危害。此病為細菌性病害，果實受害後會產生褐色水漬狀小斑點，後擴大成不規則形，無明顯邊緣，嚴重時果實變黑腐爛、果仁乾癟。

1、有的核仁是黑色的是因為沒有太熟就被摘了。表皮是黑的，俗稱黑核。但是味道是非常的甜。有的白色是因為它是自然成熟了。

2、還有一種情況下 核桃仁的皮發黑 是氧化成的 具體原因是溼核桃沒有及時晾曬 所以被氧化， 建議如果少量的話 就不要吃。