一般圈內的人在給石金錢龜配對組合的時候，通常會選擇一公配三母（這是標配），也有一公四母或者五母的情況，這是特例，公龜壯實。挑選種龜時，最好選擇6歲以上的龜，個體較大，體質健壯，活潑好動，無傷無病的公龜、母龜做親龜（育苗專用）。這樣的組合命中率高，培育出來的小龜更好，基因更有優勢一些。

目前較為流行的配對方法有如下三種：

　　第一種方法：用海南金錢龜雄性(用A表示)和北種石金錢龜雌性(用B表示)雜交，得到AB龜。AB龜的遺傳基因是各佔50%的子代。然後再用AB龜雄性與 海南金錢龜雌性(用C表示)雜交，得到的子二代是ABC龜，其遺傳基因是A龜佔25%、B龜佔25%、C龜佔50%。即A龜(海南金錢龜)佔75%、B龜 (北種石金錢)佔25%。

　　第二種方法：用北種石金錢龜雄性(用A表示)和海南金錢龜雌性(用B表示)雜交，得到AB龜。AB龜的遺傳基因同樣也是各佔50%的子代。然後再用AB龜 雄性與海南金錢龜雌性(用C表示)雜交，可得到的子二代是ABC龜，其遺傳基因是A龜佔25%、B龜佔25%、C龜佔50%。即A龜(北種石金錢)佔 25%、龜(海南金錢龜)佔75%。

　　第三種方法：用越南金錢龜雄性(用A表示)和越南石金錢龜雌性(用表示)雜交，得到AB龜。AB龜的遺傳基因是各佔50%的子代。然後再用AB龜雄性與越 南金錢龜雌性(用C表示)雜交，可得到的子二代是ABC龜，其遺傳基因是A龜佔25%、B龜佔25%、C龜佔50%。即A龜(越南金錢龜)佔75%、B龜 (越南石金錢)佔25%。

　　以上三種方法相比較：第一種方法雜交的龜苗成色淺黃肉偏紅,背甲較隆,頭額呈青金色之間;第一種方法雜交的龜苗成色偏石金錢雌龜, 沒有第一種雜交效果。這兩種方法雜交的子代經五年常溫養殖可達2.5斤左右，5年開始試蛋，六年正常產卵。

　　第三種方法雜交的子代成桔紅色之間,背隆,頭額呈灰褐色，龜體較大，常溫養殖個體可達3斤多，一般要6-7年才成熟產卵。