根據實際效果來看，一般來講蛋白量控制在2~5微克Western-blot顯印的效果比較好。上樣量太少可能顯印不出來（WB理論檢測限是皮克級），上樣量太大顯印後可能面積太大顏色過深，對判斷可能會有帶來幹擾。

RT-PCR檢測RNA的，elisa和WB檢測蛋白的（抗原或者抗體）。elisa和WB相比，靈敏度高一些，特異性差一些。

對於HIV檢測，RT-PCR和elisa的靈敏度都很高，都適合初篩，不過也都有少量漏檢（往往並不重疊），推薦兩種方法各檢測一次。

Elisa檢測孕婦HIV，可能會有假陽性。RT-PCR不會。

透過調整cut-off，RT-PCR可以同時用於確診，起到和WB類似的作用。不過目前WB還是金標準。

realtime PCR可以做基因表達量，在RNA水平。

ELISA、WB、免疫組化，原理有些類似，都是用標記的抗體（抗原），去結合相應的抗原（抗體）。但是靈敏度有些不同，定量和定性的程度也有些不同。另外，免疫組化還可以定位某蛋白在組織或者細胞中的位置。

western blot只能根據和內參的灰度比較進行半定量，不能絕對定量。

western blot可以反映出分子量的資訊，western blot一般只能做到半定量，ELISA一般可以定量。

Western Blot是目前一種結合內參對蛋白質進行半定量的方法。

可操作性western blot一次處理量就是一塊膠版，10-20個樣品最多了。

western blot操作常見的缺點為非特異性條帶，膜本底差，顯色不好等。