RNA剪下酶是催化RNA分子進行剪下反應的核酸類酶。

(1)核酸酶有DNase、RNase、核酸酶S1等，可水解相應的DNA和RNA，核酸酶S1可降解單鏈DNA和RNA，用量增大也可降解雙鏈核酸。它可用於切去ds-cDNA合成中產生的髮夾環。

(2)修飾酶有些酶可在其他酶的作用下,將酶的結構進行共價修飾，使該酶活性發生改變，核酶的催化功能與其空間結構有密切關係。

不同的核酶可分為兩類：1 剪下型核酶：只剪不接，如M1 RNA。2 剪接型核酶：該酶具有序列特異的內切核酸酶、RNA連線酶等多種酶活性。加工場所在生物體細胞質（或相關實驗裝置中）。

DNA濃溶液的粘稠度很高（長鏈DNA尤甚），如果有機械剪下力極容易打斷溶液中的DNA分子。

RNA酶能迅速降解任何型別的RNA。更糟的是，RNA酶廣泛存在於人的體表、體液、分泌物、其他生物和空氣中，所以RNA酶的汙染是提取RNA的大敵。

實際操作中

提取基因組DNA時操作必須輕柔，如需混勻液體，只能用緩慢滾轉的方法進行，切勿振盪或用手彈。

提取RNA時更需要小心，戴新的塑膠手套和口罩，在滅過菌的操作檯進行，使用的加樣槍頭、EP管和水都必須用DEPC（焦碳酸二乙酯）處理過，最後的RNA沉澱用DEPC水溶解。