依據非等位基因相互作用的性質可以將它們歸納為：

互補基因

若干非等位基因只有同時存在時才出現某一性狀，其中任何一個發生突變時都會導致同一突變型性狀，這些基因稱為互補基因。

異位顯性基因

影響同一性狀的兩個非等位基因在一起時，得以表現性狀的基因稱為異位顯性基因或稱上位基因。

非等位基因間的相互作用有

1互補作用

2重疊作用

3累加作用

4顯性上位作用

5隱性上位作用

6抑制作用

1基因互作的概念非等位基因間的相互作用叫作基因互作.基因互作是指非等位基因之間透過相互作用影響同一性狀表現型的現象,如雞的雞冠形狀的遺傳(圖1).基因互作包含了非等位基因之間的互補,積加,重疊,抑制,上位等作用.2基因互作的5種形式

非等位基因間的相互作用主有6種類型：互補效應、積加效應、重疊效應、顯性上位作用、隱性上位作用和顯性抑制作用。

1.互補效應：兩對獨立遺傳基因分別處於純合顯性或雜合顯性狀態時共同決定一種性狀；當只有一對基因是顯性，或兩對基因都是隱性時，則表現為另一種性狀，F2產生9:7的比例。

2.積加效應：兩種顯性基因同時存在時產生一種性狀，單獨存在時能分別表示相似的性狀，兩種基因均為隱性時又表現為另一種性狀，F2產生9:6:1的比例。

3.重疊效應：兩對或多對獨立基因對錶現型能產生相同的影響，F2產生15:1的比例。

4.顯性上位作用：起遮蓋作用的基因是顯性基因，F2的分離比例為12:3:1。

5.隱性上位作用：在兩對互作的基因中，其中一對隱性基因對另一對基因起上位性作用，F2的分離比例為9:3:4。

6.顯性抑制作用： 在兩對獨立基因中，其中一對顯性基因，本身並不控制性狀的表現，但對另一對基因的表現有抑制作用，F2的分離比例為13:3。