菩提老祖乃是道家祖師，雖然西遊記中以佛教為主，但佛教與道教也是不想有衝突的。

如來不願得罪菩提老祖，菩提老祖也不願得罪如來。

作為道教的祖師，菩提老祖既能窺探過去也能預知未來。他早就知道了孫悟空的命運歸屬，自然不會隨意插手，做出與如來背道而馳的事。

所以從一開始菩提老祖就跟孫悟空說過“以後闖出禍端，不要提為師的名字！”

個人覺得，菩提老祖可能想讓孫悟空身兼道教跟佛教思想，日後能更好的權衡兩者之間的關係。

個人觀點：其一，就好比我們上學的時候一樣，畢業後能玩到一起的也就是那幾個上學時玩的比較好的。孫悟空在靈臺方寸山學藝的時候也不見得他跟師兄弟們玩得很好，菩提祖師趕他走的時候也沒有師兄弟給他求情。

其二，菩提祖師算到他日後必定闖禍，為了避免連累其他學生，他將悟空趕走後帶著學生一起轉移到了別的地方去了。