1、顏色方面的區別，與普通的紅衣花生相比，黑花生衣色素的主要成分為花色苷類色素，花色苷具有抗氧化、抗突變、抗腫瘤、降低低密度脂蛋白等功能，黑花生衣色素是水溶性色素，所以在淘洗的過程中褪色是正常現象。

2、營養價值方面，黑皮花生含有更多的花青素和硒。相比於紅色花生來說，黑色花生蛋白質含量要高一些，脂肪含量低一些。

3、營養成分方面，黑色花生與普通花生相比,具有高蛋白、高精氨酸、高硒、高鉀等特點,黑花生與普通的紅衣花生相比,黑花生衣色素的主要成分為花色苷類色素,花色苷具有抗氧化、抗突變、抗腫瘤、降低低密度脂蛋白等功能。

兩者區別不大，但黑花生的營養價值要比普通花生高。據北京市營養源研究所分析報告： 黑粒花生蛋白質含量比普通花生高達5％，（精氨酸含量高，男性精子生成最需要就是精氨酸，提高性功能） 黑皮花生的皮比普通花生的皮抗氧化能力要強。 黑皮花生比普通花生脂肪含量略低1％-2％左右 黑皮花生比普通花生糖含量也略高1％左右，黑皮花生比普通花生富含硒元素比較高。