一二線城市都有。例如橫浜，名古屋，京都，福岡，札幌。。。

地鐵公營:札幌市營地下鐵(北海道札幌市)仙台市地下鐵(宮城縣仙台市)都營地下鐵(東京都區部, 千葉縣市川市)橫濱市營地下鐵(神奈川縣橫濱市, 藤澤市)名古屋市營地下鐵(愛知縣名古屋市, 日進市)京都市營地下鐵(京都府京都市, 宇治市)大阪市營地下鐵(大阪府大阪市, 堺市, 守口市, 門真市, 東大阪市, 吹田市, 八尾市)神戶市營地下鐵(兵庫縣神戶市)福岡市交通局(福岡縣福岡市) 民營:埼玉高速鐵道(東京都北區, 埼玉縣川口市, 埼玉市)東京地下鐵(東京都區部, 埼玉縣和光市, 千葉縣浦安市, 市川市, 船橋市)東京臨海高速鐵道(東京都江東區, 品川區)橫濱高速鐵道(神奈川縣橫濱市)神戶高速鐵道(兵庫縣神戶市)廣島高速交通(廣島縣廣島市) 單軌鐵路跨座式:東京單軌(東京都港區, 品川區, 大田區)多摩都市單軌(東京都東大和市, 立川市, 日野市, 八王子市, 多摩市)舞濱迪斯尼樂園線(千葉縣浦安市)大阪高速鐵道(大阪府豐中市, 吹田市, 茨木市, 攝津市, 守口市, 門真市)北九州高速鐵道(福岡縣北九州市)沖繩都市單軌(沖繩縣那霸市)懸吊式:東京都交通局上野懸垂線(東京都臺東區)千葉都市單軌(千葉縣千葉市)湘南單軌(神奈川縣鎌倉市, 藤澤市)空中軌道服務(廣島縣廣島市) 新型交通系統AGT:埼玉新都市交通(埼玉縣埼玉市, 上尾市, 北足立郡伊奈町)東京都交通局日暮里舍人線(東京都荒川區, 足立區)東京臨海新交通(東京都港區, 品川區, 江東區)橫濱新都市交通(神奈川縣橫濱市)西武鐵道山口線(東京都東村山市, 埼玉縣所澤市)山萬桉樹丘線(千葉縣佐倉市)大阪市交通局南港港鎮線(大阪府大阪市)神戶新交通(兵庫縣神戶市)導向巴士:名古屋導向巴士(愛知縣名古屋市)磁懸浮鐵道:愛知高速交通東部丘陵線(愛知縣名古屋市, 長久手市, 豐田市) 有軌電車/輕軌札幌市交通局(北海道札幌市)函館市企業局交通部(北海道函館市)東京都交通局(東京都荒川區, 北區, 豐島區, 新宿區)東京急行電鐵世田谷線(東京都世田谷區)豐橋鐵道東田本線(愛知縣豐橋市)富山地方鐵道富山市內軌道線(富山縣富山市)富山輕軌(富山縣富山市)萬葉線(富山縣高岡市, 射水市)福井鐵道福武線(福井縣福井市)京阪電氣鐵道京津線, 石山坂本線(滋賀縣大津市)京福電氣鐵道(京都府京都市)阪堺電氣軌道(大阪府大阪市, 堺市)岡山電氣軌道(岡山縣岡山市)廣島電鐵(廣島縣廣島市)土佐電氣鐵道(高知縣高知市, 南國市, 吾川郡伊野町)伊予鐵道(愛媛縣松山市)長崎電氣軌道(長崎縣長崎市)熊本市交通局(熊本縣熊本市)鹿兒島市交通局(鹿兒島縣鹿兒島市)

大阪 神戶 京都 福岡 仙台 札幌 橫濱 名古屋 廣島在日本JR線普通火車和地鐵很類似的，基本上取代了一些地鐵的功能。

很多地鐵線路到了郊外就和鐵路線連通了，比如東京的地鐵東西線經JR中央線直通運轉至三鷹，千代田線經常盤線直通運轉至我孫子。

而大阪的地鐵多連至地方鐵路（私鐵）但是鐵路不是地鐵，“每個城市都有地鐵”這種說法是不對的。

日本除了東京，大阪也有地鐵，大阪市歷史悠久，在森之宮附近發現的遺蹟證明，大阪自繩文時代中期就開始有人居住，19世紀60年代明治維新之後，新政府將造幣廠和炮兵工廠設在大阪，其中，大阪造幣局是當時世界最大的造幣局，大阪市位於大阪府中部的大坂灣沿岸地區。