藤野嚴九郎出生於日本福井縣，畢業於愛知醫學校(現名古屋大學)，醫生、教授。

1904年7月，即魯迅到仙台前兩個月，藤野由講師升為教授。藤野生活樸素，當時教授上課，來回都坐人力車，而藤野則是步行，他住在空堀町，離仙台醫專有步行三五分鐘的距離。魯迅離開仙台前曾到他家去過，他送給魯迅一張照片，背面寫上:"惜別藤野謹呈周君。"魯迅為了安慰藤野，曾故意說:"我想去學生物學，先生教給我的學問，也還是有用的。"

一輩子的師生情

1904年9月13日下午，中國留學生周樹人在仙台醫學專門學校的階梯教室與解剖學教授藤野先生初次相遇。

藤野先生的講課從日本解剖學的歷史開始。他說話有家鄉福井縣的口音，周樹人是在東京學習日語的，所以聽上去有些不習慣，但卻覺得很親切。他後來在散文《藤野先生》中，也多次說到藤野先生說話的音調起伏很大。

幾天以後，周樹人被藤野先生叫住了，他要求周樹人將課堂筆記給他看。兩三天後，筆記本還回來了，周樹人開啟一看，心中充滿驚奇與感激。只見聽課筆記中文字與圖表的錯誤，藤野先生都用紅墨水作了詳盡細緻的訂正。這種悉心指導在周樹人上藤野先生的課以後一直持續著，而兩個人的關係也越來越親近。這次相遇，對周樹人未來的道路有很大的影響。

周樹人在藤野先生的關懷下愉快地學習。一年級結束時，他順利透過考試，可以升入二年級。但這期間卻發生了一起對他打擊很大的事件。

細菌學教授中川對自己在德國買來的幻燈機很得意，就在課堂上用幻燈機放映細菌的形狀。講課時間一過，中川放映了取材於日俄戰爭的幻燈片，其中的一個場景使周樹人深感震撼。這是華人被當作俄華人間諜處決的場面。行刑場面的殘酷不用說，對於周樹人來說，更不能忍受的是周圍注視這殘酷情景的華人居然沒有任何表情。

他忽然覺得僅僅身體強壯但精神麻木的國民也是沒有什麼用的，所以，與其學習醫學強健華人的身體，不如啟蒙華人的精神。由此一想，周樹人決心從仙台醫專退學，學習文學。

決心走上文學道路的周樹人向藤野先生提出要從仙台醫專退學。被問到原因時，周樹人沒有讓藤野先生知道真實情況的勇氣，就說想去學習生物學。藤野先生很失望，就對周樹人說，為醫學而傳授的解剖學大概對學習生物學起不到什麼作用吧。分別時，藤野先生贈給周樹人一張照片，照片背面寫著：“惜別 藤野 謹呈周君”。

1909年，周樹人回到中國，在浙江省杭州市開始了他作為教師的生活。後來，他又回到家鄉紹興繼續擔任教師。

此時，新文學運動以雜誌《新青年》作為舞臺開展得轟轟烈烈。周樹人在 《新青年》上發表了《狂人日記》，並開始使用“魯迅”這一筆名。魯迅的筆名是用了母親的姓，意思是：因為魯鈍，所以行動要快。魯迅的《狂人日記》為中國現代文學發展奠下了基礎。

1926年3月18日，北洋政府計程車兵對奮起抗議進行示威遊行的北京民眾悍然開槍，造成數十人犧牲，這就是震驚中外的“三·一八事件”。

“三· 一八事件”後，當局對魯迅發出了逮捕令，魯迅只能去外華人的醫院避難。在這樣的情況下，魯迅對自己的生平進行了回顧，完成了一系列自傳體散文，《藤野先生》就是其中的一篇。

《藤野先生》是魯迅對仙台時期生活的回憶。日清戰爭後，在日本的魯迅身處蔑視中國與華人的氛圍中，深感憤怒與苦惱，為此，與向自己表示友好的藤野嚴九郎特別親近。有一位學者說，《藤野先生》 成為現在這樣的面貌是後來的事情，據說當初該文是以寫華人的憤懣為主的。結果，文章幾經推敲修改完善後，有關藤野嚴九郎的比重增大，成了將對藤野先生的回憶作為主題的作品。

以《藤野先生》為首篇在《莽原》雜誌上登載的一系列文章，後來以“朝花夕拾”為題結集出版。

1931年，剛從大學畢業的中國文學研究者增田涉從日本來上海學習。增田在上海的內山書店與魯迅相識，從魯迅那裡聽中國小說史的講課。魯迅對增田很厚愛，也許就是出於對藤野先生的報答。大約一年以後，魯迅已對他進行單獨授課。增田回國後，與魯迅的書信往來一直沒有停止。

1934年，巖波書店計劃在“巖波文庫”收入魯迅的作品，編成一冊，並由詩人佐藤春夫與增田涉翻譯。增田寫信給魯迅，問應當收入哪些作品，魯迅回信說：都可以，只要你們覺得好就收;不過，只是希望能將《藤野先生》收入。這一意見被巖波書店接受了。1935年6月，“巖波文庫”的《魯迅選集》出版。

這時候，藤野先生的兒子恆彌已經進入第四高等學校。該校由恆彌在福井中學時代的恩師菅好春擔任國語與中文老師。菅教諭讀《魯迅選集》時，發現《藤野先生》說的就是藤野嚴九郎的故事，於是就通知了恆彌。

如此一來，藤野先生才知道以前的中國留學生周樹人已經成了作家魯迅，並且將自己的故事寫入了散文。

藤野嚴九郎是魯迅先生在日本學習時的老師。

在原來小學語文教材中曾經有一篇文章就《藤野先生》。這這篇課文裡講述了藤野先生。魯迅先生在日本學習時，最開始是學醫學。藤野先生是魯迅的老師。他對魯迅要求很嚴格。他要求魯迅先生修改講義和解剖圖。他對魯迅沒有民族偏見。

後來魯迅先生棄醫學文，但是仍然感念藤野先生，曾多次尋找藤野先生，但是都沒有找到。