全真教因為丘處機邱真人受到成吉思汗的信任而發展的比較好，地位也相應很高。

全真教在元朝那可厲害了，是元朝的國教。

當時地位還是蠻高的，全真教，又稱全真道或全真派，中國道教的一個重要支派，於北宋末年至南宋初年期間由王重陽於河南終南山所創。王重陽仙遊後，由他的七位弟子輪流接任。全真教除了繼承了中國傳統道教思想以外，更將符錄、丹藥等及思想以外的內容重新整理，為今時今日的道教奠下了根基。全真七子之一的丘處機更因隨同成吉思汗西征，而使全真派在元朝得以壯大。全真教
全真教是金代興起的北方三個新道派中最大和最重要的派別，因創始人王重陽在山東寧海自題所居庵為全真堂，入道者稱全真道士而得名。全真教創建於金大定（1161——1189）年間。全真教是後期道教最大的派別之一，元代以來與正一派一起延續至今。全真教三教合一的思想非常鮮明，這是其重要的特徵之一。

全真教本身是道教的一個主流門派，開宗於輔極帝君王重陽。早在蒙古人早期時，蒙古一直信奉薩滿教，這個薩滿教是蒙古土生土長的，可以說是蒙古的國教，但後來道教一度在蒙古盛行，大有代替薩滿教的勢頭，但沒過多久，就隨著蒙古的政治因素而變弱。

說到全真教在蒙古的興起全要得力於全真教丘處機道長，也就是射鵰中經常在蒙古跑的道長。當時全真教是金國有名的大教，而丘則被世人稱為活神仙。在鐵木真成為思汗後，邀請其到蒙古探討長生之術，但其由於國家原因真到後來才去了蒙古。至於國家因素暫就不多說。丘到了蒙古後受到鐵木真的厚待，併為其修了長春宮。之後蒙古國多個政權要人都十分器重道教，給其修了多個道觀。再來說國家原因，當時金國道教信徒超級多，而蒙古為了更好的加強對滅掉金國，也重視了全真教，以緩解金人對蒙古的仇恨情緒。不過，可惜的是，在蒙古人完全拿下金國後，全真道教的政治作用就不大了，然後就被藏傳佛教給頂了下去。

成吉思汗接見丘處機，告訴成吉思汗“世界上只有衛生之道，沒有長生之藥”，治理天下應該“敬天愛民”。雖沒有得到他的完全認可，但在一定程度上減少了蒙古統治者對漢族人民的殺戮。

經過一年相處，丘處機決定東歸，大汗依依不捨，派五千精騎護送，免除全真教賦稅。後來，成吉思汗賜丘處機虎符璽書，並把金朝的御花園賞給全真教傳道。從此丘處機得以全力弘揚全真教、廣建道觀，掌管天下道觀，取得了相當於蒙古國國師的地位。全真教進入全盛時期

元憲宗時期，全真教受到打壓，詔令除《道德經》外，其餘道經一概焚燬。經此一役，全真教日漸衰弱。明、清以後，全真教更加衰落。

在元朝的各種宗教中，以佛教最受蒙古的重視。元代佛教各派別中，喇嘛教的地位最高，享有特殊地位和特權。成吉思汗尊封喇嘛教八思巴為法王、帝師，一時喇嘛教風頭無兩。在這之前，全真教也有過高光時刻。

“全真七子”的丘處機成為掌門人後，由於信徒眾多，全真教在北方名聲大振。丘處機年屆七旬，鶴髮童顏、碧眼方瞳，外界紛紛傳說他有“長生不老之術”和“治理天下之術”，更有甚者傳言丘處機300多歲了。這些傳說傳到老年成吉思汗的耳朵中，成吉思汗寫信誠懇邀請丘處機西行傳道解惑。

一年之後，丘處機帶領弟子在阿富汗見到60多歲的成吉思汗。丘處機告訴成吉思汗“世界上只有衛生之道，沒有長生之藥”，治理天下應該“敬天愛民”。丘處機的“秘方”並非成吉思汗的真正需要，並沒有得到他的完全認可，在一定程度上減少了殺戮。