副巡視員與二級巡視員區別還是蠻大的，主要區分三種情況

第一種情況：由副巡視員套改的二級巡視員，屬於副廳級非領導職務，享受一定的政治待遇

2019年6月份之前，省廳機關的副巡視員，屬於副廳級非領導職務，由省委組織部管理，級別高於正處級，一般情況下列入廳領導序列，分管1-2個科室，有潛力的或者受到廳領導器重的，還會進入廳領導班子，擔任廳黨組成員，下面的人見到副巡視員都稱呼“XX廳”。副巡視員，可以享受參閱一定級別的密級檔案、參加全省副廳級幹部會議、參與本廳大項事務決策等政治待遇，可以享受擁有副廳級幹部獨立辦公室、乘坐高鐵一等座或者飛機頭等艙、帶隊檢查下屬單位工作等工作待遇，可以享受副廳級幹部的經濟待遇（除去職務工作）。2019年6月份，全國實行職務與職級並行政策，省廳機關副巡視員套改為二級巡視員，套改後不改變幹部管理許可權，不改變幹部政治待遇、工作待遇和經濟待遇。

因此，由副巡視員套改的二級巡視員，仍然還是省管幹部，仍然享受副廳級非領導職務的一切待遇。

第二種情況：職務與職級並行政策實行後晉升的二級巡視員，屬於副廳級待遇職級，不享受政治待遇

2019年6月份之後，全國實行職務與職級並行政策，二級巡視員由一級調研員晉升而來。按照新的公務員法和職務職級並行規定，由一級調研員晉升的二級巡視員，只享受副廳級的工資待遇，不享受副廳級政治待遇和工作待遇，不能參與一定許可權的檔案，不能乘坐高鐵一等座，幹部管理許可權仍屬於廳黨組，編制在機關處室內部。

由於2019年6月份之後晉升的二級巡視員編制在機關處室，部分人認為處長可以管理二級巡視員，可以安排二級巡視員工作。其實不然，能夠晉升二級巡視員的，絕大多數擔任過處長，甚至是經歷資深的處長，或者是某一方面的專家，晉升為二級巡視員後，雖然不再擔任處長，但從業務素質、管理能力、綜合素養上來說，他們都是難得的人才，廳裡很多業務工作也得倚重他們出謀劃策、把關稽核。因此，對2019年6月份之後晉升的巡視員，大多數省廳機關一般安排他們協助副廳長管理1-2個處室，擁有工作指導權，但是沒有簽字權和決定權。被協助管理的處室，很多業務工作也得請示二級巡視員。

第三種情況：廳級領導職務轉非改任的二級巡視員，屬於副廳級非領導職務，享受一定的政治待遇

分為兩種情況：

①接近退休的副廳級領導職務轉非改任的二級巡視員。絕大多數58歲以上的接近退休年齡的副廳級領導職務，都會轉非改任二級巡視員，退休前再伺機晉升為一級巡視員。這種情況的二級巡視員，並不因為轉非而改變幹部管理許可權，還是屬於省管幹部，可以享受基本的政治待遇、工作待遇和經濟待遇，有的還繼續擔任廳黨組成員。

②廳級領導職務非正常情況下轉非改任的二級巡視員。一些廳級領導或是因為違規違紀，或者工作不力發生較大負面影響生，或者因為身體原因，從廳級領導職務轉非改任為二級巡視員。這種情況的二級巡視員，還是屬於省管幹部，同樣享受基本的政治待遇、工作待遇和經濟待遇，有的還繼續擔任廳黨組成員。

綜上同屬於二級巡視員，管理許可權不一樣，屬於省管幹部的二級巡視員，除了工資待遇外，還享受一定的政治待遇；屬於廳管幹部的二級巡視員，除了工資待遇之外，原則上不享受政治待遇，但因為其豐富的工作經驗、較強的業務能力，受到領導器重，可能會安排協管1～2個處室，還會參加領導決策會議，有一定的政治待遇。