Windows XP: C:\Documents and Settings\All Users\Shared Documents\EndNote
Windows Vista: C:\Users\Public\Public Documents\EndNote
這裡儲存了當前電腦下所有使用者可用的檔案
偏好目錄
EndNote 的一些偏好設定，都儲存在這些資料夾內。注意這些資料夾多是隱藏資料夾，一般看不到
Windows 7: C:\使用者\使用者名稱\App Data\Roaming\EndNote
Windows 8: C:\使用者\使用者名稱\App Data\Roaming\EndNote
Windows XP: C:\Documents and Settings\使用者名稱\Application Data\EndNote
Windows Vista: C:\使用者\使用者名稱\App Data\Roaming\EndNote
EndNote 資料庫
EndNote 的資料庫一般是儲存於「我的文件」下面，當然這也是因當時建立資料庫時選定的目錄而定。
EndNote 的資料庫要注意以下幾點
每一個 EndNote 的資料庫都包含一個 .enl 檔案和相應的 DATA 目錄
重新命名資料時一定要對這個 enl 檔案和相應的 DATA 資料夾同時重新命名，不然會報錯。比如現在有一個數據庫是 My EndNote Library.enl，其對應的 DATA 資料夾會是 My EndNote Library.Data；現在重新命名成 howsci.enl，也要同時重新命名其相應的 DATA 資料夾為 howsci.Data
移動或者複製資料庫時，也要同時移動或者複製資料庫 enl 檔案和相應的 DATA 資料夾
DATA 資料夾記憶體儲資料庫的一些資訊，如 PDF 附件和圖片附件等等
在為文獻新增附件時，建議選中「Copy this file to the default file attachment folder and creat a relative link」選項，這樣附件才能複製到 EndNote 資料庫中。否則資料庫只是儲存了附件的絕對連結。選中該項的好處是管理起 PDF 附件來方便多了，可以刪除原來的 PDF 檔案，而不用擔心附件打不開。如果不選中，則原始的 PDF 檔案目錄和名稱都不能更改和刪除，很麻煩
找到 PDF 附件所在目錄的方法：如果新增附件時選中了「Copy this file to the default file attachment folder and creat a relative link」選項，那麼 PDF 檔案就位於 DATA 檔案內。一個附件對應一個子資料夾，不過資料夾名稱是隨機數字組合。找到 PDF 附件最簡單的方法是在資料庫選中到相應的文獻，然後依次開啟選單 References >> File Attachment >> Open File；或者右擊文獻，在擴充套件選單中選擇 File Attachment >> Open File；或者在 PDF檢視面板右擊 PDF 附件，選擇「Open with XXX」選擇第三方 PDF 閱讀器開啟，然後在第三方 PDF 閱讀器中選擇選單 檔案 >> 文件屬性，即可看到該 PDF 附件的儲存位置
EndNote 的檔案目錄雖然很簡單，但是也有一些人在問，本文就詳細的說明一下 EndNote 的所有檔案目錄。
EndNote 安裝目錄
如果是典型安裝的話，EndNote 的安裝目錄一般是位於系統盤內，多是如下目錄：
C:\Program Files\EndNote X7 (32 位作業系統)
C:\Program Files (x86)\EndNote X7 (64 位作業系統)
安裝目錄內含有 EndNote 程式的大部分檔案，如
Connections 資料夾：儲存了一些常用的線上資料庫的連線檔案
Filters 資料夾：儲存了 EndNote 安裝的濾件
Styles 資料夾：儲存了一些 SCI 雜誌的輸出格式
Templates 資料夾：儲存了一些 SCI 雜誌的稿件模板
Terms Lists 資料夾：儲存了一些術語表
EndNote 個人目錄
EndNote 個人目錄是儲存修改或者建立的濾件，連線檔案，輸出格式等等檔案。個人資料夾因作業系統不同而不同，一般是位於「我的文件」資料夾下
Windows 8: C:\使用者\使用者名稱\Documents\EndNote
Windows 7: C:\使用者\使用者名稱\Documents\EndNote
Windows XP: C:\Documents and Settings\使用者名稱\My Documents\EndNote
Windows Vista: C:\使用者\使用者名稱\Documents\EndNote
這裡的「使用者名稱」是指當前電腦下的使用者名稱，這是安裝作業系統時設定的。
強烈建議把「我的文件」移至非系統盤下，這樣可以保證在重灌系統的時候不丟失檔案。移動方法有很多最佳化軟體都可以辦到，當然也可以自己手動修改。
比如 Windows 7，開啟當前使用者的庫，在左側「文件」下「我的文件」子目錄上右擊，選擇屬性 >> 位置，輸入新位置，然後「移動」即可。其他作業系統類似，或者網上搜搜就有方法。
注意：
EndNote 自己建立或修改濾件，連線檔案，輸出格式要儲存在個人資料夾內，這樣在重灌 EndNote 的時候，自己辛辛苦苦建立或者修改的東西才不會丟
個人目錄還受 EndNote 設定的影響，依次開啟選單 Edit >> Preferences >> Folder Locations
共享目錄
Windows 8: C:\使用者\Public\Public Documents\EndNote
Windows 7: C:\使用者\Public\Public Documents\EndNote
Windows XP: C:\Documents and Settings\All Users\Shared Documents\EndNote
Windows Vista: C:\Users\Public\Public Documents\EndNote
這裡儲存了當前電腦下所有使用者可用的檔案
偏好目錄
EndNote 的一些偏好設定，都儲存在這些資料夾內。注意這些資料夾多是隱藏資料夾，一般看不到
Windows 7: C:\使用者\使用者名稱\App Data\Roaming\EndNote
Windows 8: C:\使用者\使用者名稱\App Data\Roaming\EndNote
Windows XP: C:\Documents and Settings\使用者名稱\Application Data\EndNote
Windows Vista: C:\使用者\使用者名稱\App Data\Roaming\EndNote
EndNote 資料庫
EndNote 的資料庫一般是儲存於「我的文件」下面，當然這也是因當時建立資料庫時選定的目錄而定。
EndNote 的資料庫要注意以下幾點
每一個 EndNote 的資料庫都包含一個 .enl 檔案和相應的 DATA 目錄
重新命名資料時一定要對這個 enl 檔案和相應的 DATA 資料夾同時重新命名，不然會報錯。比如現在有一個數據庫是 My EndNote Library.enl，其對應的 DATA 資料夾會是 My EndNote Library.Data；現在重新命名成 howsci.enl，也要同時重新命名其相應的 DATA 資料夾為 howsci.Data
移動或者複製資料庫時，也要同時移動或者複製資料庫 enl 檔案和相應的 DATA 資料夾
DATA 資料夾記憶體儲資料庫的一些資訊，如 PDF 附件和圖片附件等等
在為文獻新增附件時，建議選中「Copy this file to the default file attachment folder and creat a relative link」選項，這樣附件才能複製到 EndNote 資料庫中。否則資料庫只是儲存了附件的絕對連結。選中該項的好處是管理起 PDF 附件來方便多了，可以刪除原來的 PDF 檔案，而不用擔心附件打不開。如果不選中，則原始的 PDF 檔案目錄和名稱都不能更改和刪除，很麻煩
找到 PDF 附件所在目錄的方法：如果新增附件時選中了「Copy this file to the default file attachment folder and creat a relative link」選項，那麼 PDF 檔案就位於 DATA 檔案內。一個附件對應一個子資料夾，不過資料夾名稱是隨機數字組合。找到 PDF 附件最簡單的方法是在資料庫選中到相應的文獻，然後依次開啟選單 References >> File Attachment >> Open File；或者右擊文獻，在擴充套件選單中選擇 File Attachment >> Open File；或者在 PDF檢視面板右擊 PDF 附件，選擇「Open with XXX」選擇第三方 PDF 閱讀器開啟，然後在第三方 PDF 閱讀器中選擇選單 檔案 >> 文件屬性，即可看到該 PDF 附件的儲存位置