糖類科學研究的障礙之一,然而也正是因為這種複雜性給糖鏈帶來了多樣的生物活性。

認為構成生物體的蛋白質的一半以上受到了糖鏈修飾，糖鏈修飾在蛋白質的結構、功能的調節中發揮重要的作用。另外，透過近年來的研究，已知在細胞表面上表達的糖鏈參與細胞間相互作用、訊號傳遞、發育/分化、進而受精、癌症轉移等各種各樣的生物體內現象。

修飾蛋白質的糖鏈很少是單糖以直鏈狀連線而成的結構，在大多的情況下具有分支結構。這種具有分支結構的糖鏈的結構非常富有多樣性，其結構對蛋白質的功能產生重大影響。因此，糖鏈的結構解析在生理學、生命科學、醫學等各種領域中是重要的。

近年來，糖鏈的結構解析中，廣泛利用了質譜分析、特別是被稱為串聯質譜分析、多級質譜分析(MSn)等的伴有針對離子的解離操作的質譜分析。使用質譜分析的糖鏈結構解析通常基於在正離子模式下獲取的質譜(本說明書中，有時透過MS/MS分析得到的MS/MS譜等也稱為質譜)來進行。但是，若使正離子化的糖鏈透過碰撞誘導解離(CID)法解離，則往往在單糖間的糖基鍵處發生解離，難以得到分支結構的資訊。因此，這種方法在推定構成糖鏈的單糖時是有用的，但不太適於具有分支結構的糖鏈的結構解析。

與此相對，雖然不太常規，但也嘗試了基於在負離子模式下獲取的質譜的糖鏈結構解析。

已知，若使負離子化的糖鏈透過CID解離，則反映分支結構的解離容易特異性地發生。例如N型糖鏈中，分別容易生成反映二條分支中的1-6臂的結構資訊的D離子、反映1-3臂的結構資訊的E離子，透過檢測這些離子而能夠推定分支結構。而且，這些產物離子被認為是透過單純的一次斷裂而生成的，具有如下特性：與透過複雜的二次斷裂或三次斷裂而生成的離子相比，原分子的結構資訊容易直接反映於產物離子。因此，例如在質譜上觀測到某個特定的產物離子的情況下，具有能夠進行唯一確定原分子的部分結構的診斷性解析的優點。由此，可以說負離子模式下的質譜分析在具有分支結構的糖鏈的結構解析中是有利的。

然而，原本糖鏈就有難以負離子化的問題。作為單糖之一的唾液酸具有羧基，因此容易帶負電荷。因此，包含唾液酸的酸性糖鏈比較容易成為負離子，但是，在實際測定中也往往為了防止唾液酸的損失而透過前處理進行衍生物化，使得唾液酸部分的負電荷被中和。因此，通常即使在糖鏈中包含唾液酸的情況下，也需要使實質上不具有會發生去質子化的官能團的中性糖鏈進行負離子化。

糖鏈，可以說是一種決定了“細胞臉面”特徵的物質。

因為糖鏈不僅決定了紅細胞(紅血球)的型別，而且在細胞和細胞之間進行交流的過程中也起到了非常重要的作用。例如，卵子和精子相遇的受精過程，以非常快的速度傳導資訊的神經結構，都要涉及細胞之間依靠糖鏈互相識別。現在，研究人員已經越來越清楚地認識到，糖鏈不僅是維持我們機體正常執行的一種必不可少的物質，而且它與多種疾病的發生都有著密切的聯絡。

所以說糖鏈結構多樣性