簡單地說，就是到稅務局辦稅大廳綜合視窗去開具稅票，然後稅務局系統透過稅銀協議把稅款劃轉到國庫。

但在實際操作中有不同的方法：

1、稅務局已下稅務處理決定書

這種情況下，稅務局對你的檢查已經結束並且形成了最後的處理決定，多數情況下你只有服從的份了。就是要在稅務處理決定書上要求的期限前，按照稅務局的處理決定上載明的稅款和罰款，到辦稅大廳補繳稅款，當然，還要按稅款形成月份按日加收萬分之五的滯納金。

如果你對稅務局的處理決定有異議，準備行政複議或行政訴訟，按照稅收徵管法的規定，不能直接提起行政複議或行政訴訟，要先把稅務局的處理決定書上載明的稅款和罰款繳納完畢才能提出行政複議或行政訴訟。

2、稅務局還未出具稅務處理決定書

也就是說，稅務檢查人員已經查出了你的問題，你也沒有異議，為了表明自己的態度，減少後續的損失，提前主動去補繳稅款。這時候，就需要你自行填寫好納稅申報表，自行到辦稅大廳去繳納稅款。不過要注意，填寫納稅申報表時要按稅種、按稅款發生的月份分別填寫，不能籠統地填寫在一起。比如稅務局初步查實你少繳稅款10萬元，其中增值稅是某年1月份1萬元，2月份1萬元，5月份3萬元，企業所得稅某年5萬元。你就需要分別填寫3張增值稅申報表和1張企業所得稅申報表，蓋章後帶著到辦稅廳去補交稅款，當然滯納金都少不了，稅務局系統會自動計算加收。

這種做法有個好處，就是可以減少滯納金的繳納，因為稅務檢查程式是比較長的，經常光檢查環節就2-3個月，有時候檢查結束了，內部的審理程式也可能會拖好幾個月，所以如果沒有異議的話，如果在稅務處理決定書下發之前繳納，一是可以減少滯納金的繳納，畢竟滯納金是按日加收萬分之五，三個月就將近5%的稅款，金額還是很大的。二是表明積極配合的態度，稅務局在加收罰款時會考慮到你積極配合的因素，有可能會按照0.5倍的底限來加收罰款。

首先題主必須要明白依法納稅是每個公民的應盡的義務，不論是個人還是用人單位都必須依法納稅，偷稅數額較大是要受到刑罰處罰的，如果公司偷稅被查出來後不及時補交稅款，可能還會被判刑。

根據《刑法》第二百零一條的規定，除五年內因逃避繳納稅款受過刑事處罰或者被稅務機關給予二次以上行政處罰的情形之外，經稅務機關依法下達追繳通知後，補繳應納稅款，繳納滯納金，已受行政處罰的，不予追究刑事責任，可以不再追究刑事責任。但是，如果是涉嫌透過虛開增值稅專用發票或其它發票等方式進行逃稅的，則構成虛開增值稅專用發票罪或其它罪名，仍應該刑事立案以追究刑事責任。

被查出偷稅怎麼補交稅款？

如果是在被查出偷稅的情況下去補繳，那題主只能根據稅務局的要求去做，在規定的期限內將稅款以及滯納金給補上。

在補繳之前，需要提供以下材料：

需補繳人姓名；需補繳人身份證號碼；需補繳人月工資金額；需補繳人要補繳的月份；需補繳人地址及郵編。

之後，題主需要做好補交申報報表，然後提交到稅務局，由稅務局出具通用繳款書，最後到銀行去進行繳稅，繳完稅3-5天即可出具完稅證明。如果題主有異議的可以向由行政複議或行政訴訟，不過還是得在這筆款項繳納完之後才能提出行政複議或行政訴訟。

想要獲取寬大處理和減少損失，最好提前主動去補繳稅款，可以減少滯納金的繳納，因為稅務檢查程式是比較長的，經常光檢查環節就2-3個月，有時候檢查結束了，內部的審理程式也可能會拖好幾個月。

所以如果沒有異議的話，如果在稅務處理決定書下發之前繳納，一是可以減少滯納金的繳納，畢竟滯納金是按日加收萬分之五，三個月就將近5%的稅款，金額還是很大的。二是表明積極配合的態度，稅務局在加收罰款時會考慮到你積極配合的因素，有可能會按照0.5倍的底限來加收罰款。

公司偷稅被查出來後及時補交稅款，還會被判刑嗎?

1、公司偷稅被查出來後及時補交稅款，還會被判刑嗎?

存在偷稅行為，在被查出來後，經稅務機關依法下達追繳通知後，補繳應納稅款，繳納滯納金，已收行政處罰的，不予追究刑事責任;但是，五年內因逃避繳納稅款受過刑事處罰或者被稅務機關給予二次以上行政處罰的除外。

2、公司逃稅漏稅後，登出公司的，還會被追徵稅款嗎?

公司偷稅漏稅後，雖然登出公司，但公司留存的相關財產，如房產、辦公裝置、未售出的產品、原材料等公司合法擁有的財產均可以被依法查封拍賣，作為公司欠繳稅款被徵收，同時公司股東及相關責任人也會被追究責任。

3、如果公司將偷稅、騙稅等證據毀了，而且拒不承認的，會怎麼辦?

納稅人採取欺騙、隱瞞手段進行虛假納稅申報或者不申報，逃避繳納稅款數額較大並且佔應納稅額百分之十以上的，處三年以下有期徒刑或者拘役，並處罰金;數額巨大並且佔應納稅額百分之三十以上的，處三年以上七年以下有期徒刑，並處罰金。

4、公司透過偷稅，漏稅獲取大量非法利益後，將公司轉讓給善意第三人的，怎麼辦?

公司作為納稅人偷稅、漏稅，應依據刑法第二百零一條處罰。第三人接手公司後，納稅主體並未改變，公司依然要承擔相應法律責任，包括補繳稅款、繳納罰金等。善意第三人作為股東，可以向公司原股東和負責人追償。

5、公司法人代表變更後，被查出偷稅的，那原法人代表要負法律責任嗎?

公司偷稅，對單位判處罰金，並對其直接負責的主管人員和其他直接責任人員，依照刑法第二百零一條處罰。原法定代表人如果是公司主管人員或直接責任人，需要承擔相應法律責任，變更法定代表人不影響刑法處罰。