軍機處的主要職能是：軍機大臣每日接受皇上召見，跪受筆錄，負責皇帝下達諭旨的撰擬和參預官員上報之奏摺文書的處理。辦理皇帝交議的大政，某些重大案件，皇帝特交軍機大臣審理擬定，或由軍機大臣會同三法司審擬。

軍機處的特點是：軍機處實行了嚴格的歸檔保密規定，辦事效率很高。清軍機處還設有專門的檔案房，有專職的保密人員管理這些檔案，由此而使軍機處的保密工作做得非常之好，同時，為後代留下了許多難得的珍貴史料。

軍機處的建立,標誌著中國封建君主集權的進一步強化。是清王朝對中央行政機構的一次重大變革，表現出清代前期政治制度高度集權的趨向。軍機處成立以後，逐漸代替了清建國以來所依靠的滿洲親王，貝勒參預議政的制度，廢除了議政處；同時也削弱了內閣參預國政的權力。

軍機處是清朝官署名，也稱“軍機房”、“總理處”。是清朝時期的中樞權力機關，於雍正七年（1729年）因用兵西北而設立。雍正帝以內閣在太和門外，恐漏洩機密，始於隆宗門內設定軍機房，選內閣中謹密者入值繕寫，以為處理緊急軍務之用，輔佐皇帝處理政務。雍正十年（1732年），改稱“辦理軍機處”。設軍機大臣、軍機章京等，均為兼職。乾隆帝時期復設軍機處，從此成為清朝的中樞權力機關，一直到清末。

軍機處總攬軍、政大權，成為執政的最高國家機關。完全置於皇帝的直接掌握之下，等於皇帝的私人秘書處。同時，軍機處在權力上是執政的最高國家機關，而在形式上始終處於臨時機構的地位。

另外，軍機處在辦公場所和官員設定上沒有正式的規定，也無品級和俸祿。需要強調，軍機處雖然是國家最高權力機構，但歸根結底聽命於皇帝，成為封建皇權的統治工具。宣統三年（1911年）四月責任內閣成立後軍機處被撤銷。

軍機處主要職能如下：

軍機處初設時，所掌僅限軍務。《清史稿·軍機大臣年表序》說：“初只承廟謨商戎略而已。”但以後事權逐漸擴大，軍國大計，罔不總攬。自雍、乾後百八十年，威命所寄，不於內閣而於軍機處。 其具體職掌有如下幾方面：

1、負責皇帝下達諭旨的撰擬和參預官員上報之奏摺文書的處理。

官員上報的文書，凡摺奏“請旨”者歸軍機處，照例的題本歸內閣，直到清末未變。雍正帝每天召見軍機大臣，有時一天召見數次，像在西北用兵緊張之時，張廷玉“內直自朝至暮”，“間有待至一二鼓”。

2、辦理皇帝交議的大政，凡遇重要政事，皇帝不能裁決的，或交軍機處議奏，或密議，或交軍機處會同關係衙門議奏。

如大學士史貽直未入軍機處，然在統一新疆戰爭中，乾隆每每與其商議，史載“公（史貽直）在政府，時從容承召對，移晷乃出，而公謹慎周詳，雖子弟不得與聞。”特交的，由軍機處查議其可否，密擬辦法上奏；會同議奏的，或由軍機處主稿，或由所會衙門主稿，臨時酌定。

3、某些重大案件，皇帝特交軍機大臣審理擬定，或由軍機大臣會同三法司審擬。軍機大臣可在軍機處提訊，也可使用刑訊。應刑訊時，選用內務府公所或於步軍統領衙門進行。凡秋審案件，軍機大臣也參預。

4、重要文武官員之任免及各部尚書、侍郎、各省總督、巡撫、以至道、府、學政、關差、鹽政以及駐防將軍、都統、駐各邊疆地區之領隊大臣、辦事大臣等官員的補放，均由軍機大臣負責開列應補人員名單，交皇帝選擇任用。

遇科考，也由軍機大臣開列主考、Quattroporte名單，奏請皇帝選用。複試或殿試，軍機大臣負責核對試卷、檢查筆跡或任命閱卷官。

5、考查行軍之山川、道里與兵馬錢糧：凡有行軍，軍機處根據有關圖書，考查山川險要，道里遠近，如系邊遠地區，圖書中沒有記載的，要考查新舊檔案並加諮訪。應用的兵馬、錢糧，則由戶部、兵部、理藩院等衙門取簡明確數備查。遇有皇帝查訊的問題，即時呈遞。

6、軍機大臣可奉皇帝旨意，以“欽差”身分，往各地檢查或處理一些政事。如嘉慶十八年（1813年），欽差大臣、直隸總督那彥成鎮壓河南天理教起義有功，嘉慶帝大加稱讚，加太子少保銜，賞三等子爵。

1.擬寫皇帝釋出的諭旨

皇帝特降的諭旨、或因官員奏請而下的諭旨，都由軍機大臣承皇帝之意，擬寫呈閱，皇帝閱定以後，凡公開宣示的，交內閣頒發，機密的或個別諭行的（《光緒會典》說“或速諭或密諭”），由軍機大臣封寄（上諭等件均抄錄存檔）叫廷寄。

按官員上報文書說，凡摺奏“請旨”者歸軍機處（錄副送內閣傳抄，抄畢交回存檔，即現存軍機處檔案之錄副奏摺），照例的題本歸內閣辦理。

2.辦理皇帝交議的大政

凡遇重要政事皇帝不能裁決的，或特交軍機處議奏或密議，或交軍機處會同關係衙門議奏。特交的，由軍機處查議其可否，密擬辦法上奏；會同議奏的，或由軍機處主稿，或由所會衙門主稿，臨時酌定。

1、跪承旨意

軍機處的最重要的職責就是將全國各地的奏摺彙集起來，交給雍正皇帝。由雍正皇帝審批，他們再按照雍正皇帝的旨意來執行。因此，軍機處的大臣們每天的任務就是等待皇帝召見，和皇帝之間的關係非常親近。

2、向皇帝推薦官員

軍機處的官員的品階並不是更高，有些官職只有五品，而且大都是兼職。但是軍機處的官員有權利向皇帝推薦官員，上至大學士，下至七品縣令。

在任職的時候，軍機處的官員都可以向皇帝推薦。因此，軍機處的官員可以稱為皇帝跟前的“紅人”，一般的官員都不敢輕易得罪他們。

3、皇帝日常的“秘書”

軍機處掌管著全國的軍餉、糧餉，山川和河流分佈等等其他的重要資料，以備皇帝的詢問。

同時，還會幫助皇帝起草一些賞罰的詔書，並接受一些重要的檔案。軍機處的設立在一定程度上可以緩解皇帝的行政壓力。