轉基因植物的利有以下幾點：

一、能夠大幅度降低生產成本，提升品質和產量。其抗病、抗蟲、抗除草劑特性還可以大幅度減少農藥用量，利於保護環境。

二、將豆科植物的固氮特性轉移到小麥和玉米等大宗農作物中，能夠大幅度降低化肥用量。

三、部分轉基因農作物具有預防和治療疾病的作用，可以用來開發生產功能性食品。

三、四季常青的轉基因牧草能夠大幅度提高單位面積牧場的載畜量並防止草原沙化。

 四、耐寒、耐旱的新品種能夠使不能耕種的高緯度和高海拔地區變成牧場甚至良田。

轉基因農作物的弊端：

一、對生態環境影響的遠期不確定性。儘管目前的研究證明其對生態環境沒有明顯的不良影響，但長期大規模種植對生態環境的影響尚不確定。

二、對人體健康影響的遠期不確定性。食物品種和食物結構的長期改變，究竟會對人體健康產生什麼樣的影響，尚需長期觀察和研究。

 三、已有研究證明，對於某個物種過敏的人群，由於該物種的基因轉移到了另一物種，該過敏人群也可能會對該新物種產生過敏反應。而該過敏人群可能預先並不清楚，從而產生不可預料的後果。

 四、醫療上抗生素長期大量使用，產生了具有耐藥性的細菌變種，使部分抗生素失靈。高抗性物種的大規模推廣也可能催生新的有害物種。

轉基因作物自誕生之日起，就是爭議不斷。我們不可否認的是，轉基因作物與傳統育種方法培育的作物相比有著許多常規作物難以比擬的優勢：

（1）解決糧食短缺的問題，轉基因的作物其產量有明顯的上升，而且對於病蟲害和逆境災害也有著更好的抗性，有效緩解糧食危機。

轉基因玉米的產量有著明顯的提高

（2）減少農藥使用，避免環境汙染。例如轉BT基因的抗蟲棉，可以有效的抑制棉鈴蟲對棉花的危害，從而就可以減少在棉花生長週期中對抗棉鈴蟲農藥的使用。

BT抗蟲棉有效抑制棉鈴蟲

（3）節省生產成本，降低食物售價。由於在作物的生長週期中減少農藥等藥劑的使用量以及作物產量的上升，就可以節省成本，從而在價格上更有競爭力。

（4）增加食物營養，提高附加價值。由於轉基因育種是將外源基因匯入到植物體內，就可以有選擇性的將一些營養元素匯入植物體內，例如黃金大米就是提高了水稻中維生素A的含量，但其食用的安全性還有待進一步的探究。

黃金大米能否食用還沒有定論

雖然轉基因作物可以帶來很多的好處，但是我們同樣不能忽視其潛在的危害，簡單的可以概括為：

（1）轉基因作物的環境安全性

轉基因作物演變為農田雜草的可能性，由於轉基因作物普遍耐除草劑，一旦其發生變異就可能突變成超級雜草，對作物產量造成威脅。

基因漂流到近緣野生種的可能性，就有可能導致其野生種發生某種未知變異，無異於相當於埋下了一顆定時炸彈。

對自然生物類的影響，轉基因作物抗除草劑基因和抗蟲基因雖然對作物本身有利，但也可能會破壞生態平衡。

轉基因作物的危害的風險性還沒有準確的定論

（2）轉基因作物的食品安全性(food safety)

有毒物質：轉基因作物中的毒素可引起人類急、慢性中毒或致癌、致突變作用。

過敏源：作物中的免疫或致敏物質可使人類機體產生變態或過敏反應。

轉基因作物中的主要營養成分、微量營養成分及抗營養因子的變化，可能降低食品的營養價值，使營養結構失衡，降低人體免疫力。

不過，到目前為止，這種技術仍然處於起步階段，並且沒有一種含有從其它動植物上種植基因的食物，實現了大規模的經濟培植。同時許多人堅持認為，這種技術培育出來的食物是“不自然的”。總之，看待問題要有兩面性，對於轉基因技術而言，能否在生產上大面積應用還有很長的一段路。