崑崙山脈與塔里木盆地和柴達木盆地間均以深大斷裂相隔。崑崙山地區以前震旦係為基底；古生代時為強烈下沉的海域並伴有火山活動，古生代末期經華力西運動褶皺上升，構成崑崙中軸和山脈的中脊；中生代產生拗陷，經燕山運動構成主脊兩側4000米以上的山體。崑崙山脈與構成分隔中國南部與北部的緯向山脈。

喀喇崑崙山屬燕山褶皺 系。大地構造的發育主要與南亞次大陸向北位移並與歐亞大陸碰撞有關。主要大地構造期開始於白堊紀，並繼續到第三紀；

山地抬升開始於晚第三紀，仍在進行。巖性以花崗岩、片麻岩、結晶板岩及千枚巖為主，南北兩側主要為石灰岩和雲母板岩。南側沉積岩常為花崗岩侵入體所切割，若干地區有板岩出露。

喀喇崑崙山地震活動頻繁，震級甚至有達9級以上者。有溫泉分佈。聳立於青藏高原西北側，連結著帕米爾高原、喜馬拉雅山及崑崙山脈。其主體部分在新疆維吾爾自治區與克什米爾的交界線上，青藏高原西北部是它的東延部分。

秦嶺不是崑崙山,這是兩個地方。

1.

崑崙山不是秦嶺。崑崙山脈(崑崙山),又稱崑崙虛、中國第一神山

2.

秦嶺,是橫貫中國中部的東西走向山脈。西起甘肅省臨潭縣北部的白石山,向東經天水南部的麥積山進入陝西

三江源區是青藏高原的腹地和主體，以山地地貌為主，山脈綿延、地勢高聳、地形複雜，最低海拔位於玉樹藏族自治州東南部的金沙江江面，平均海拔4千米左右。

主要山脈為東崑崙山及其支脈阿尼瑪卿山、巴顏喀拉山和唐古拉山山脈。因受第四紀冰期作用和現代冰川影響，海拔5千米以上的山峰可見古冰川地貌。

保護區中西部和北部呈山丘原狀，起伏不大、切長、排水不暢，形成了大面積沼澤。東南部高山峽割不深、多寬闊而平坦的灘地，因地勢平緩、冰期較地帶，切割強烈，相對高差多在1千米以上，地形陡峭，坡度多在30度以上。