首先是孟德爾是一個身份十分卑微的人，沒有顯赫的家世，沒有從師有名望的導師。他只是一家小鎮上修道院的一名業餘生物愛好者，說得好聽點，就是一名有知識的園藝工作者，難聽一點，就是一名種菜的。他是進入修道院後，依靠自己的聰明和勤奮，獲得修道院院長的賞識，有機會進入大學進修。他一個人在菜園中辛苦耕作了八年，利用豌豆，發現了遺傳的規律性。

其次是孟德爾並不是一個熱衷於發表論文的人。他在宣讀論文後，也只是該年會出版了會刊按傳統郵寄到各大研究機構，同時給他出了四十本論文單行本。他把單行本送給了當時世界最有名的生物學家。結果沒有收到科學家的回信，也就是杳無音信，可想而知，他當時是多麼的讓人看不起。他並沒有想到把論文再次轉投其它會刊發表。

第三是他認錯了人。孟德爾寫出的論文，這是他八年辛苦試驗的結晶，他還是想把自己的成果介紹給學術界。可是沒有人理睬來自小地方修道士寄來的論文呢？他一次又一次給當時著名生物學家拿格里寫信，把自己的實驗過程以及實驗中思考都給他做了介紹，甚至於還郵寄了豌豆種子給他。著名生物學家拿格里在信中不但不鼓勵支援他，反而傲慢地教訓孟德爾：你的實驗還遠遠沒有完成，其實只是一個開端，建議改用“山柳菊”重複此實驗。拿格里是當時首屈一指的影響力大的專家，他是一個融合遺傳的堅定支持者，而孟德爾雜交試驗是第一個推翻和否定“融合遺傳”的實驗，創立新的遺傳理論“顆粒遺傳”。這對拿格里來說，簡直就是大逆不道，他在1884年出版有關遺傳與進化的大部頭著作，總結了他所知道的有關植物雜交的所有實驗，唯獨沒有一個字提到孟德爾，可見他是如此地輕視。

第四是他最糟糕的是聽從了拿格里的建議，用山柳菊做雜交試驗。山柳菊根本不適合用來做雜交實驗，因為他的花非常小，不利於人工去雄和傳粉，而且當時還不為人知的是它有時進行有性生殖，有時進行無性繁殖，這樣是根本不可能在它的後代中出現穩定的數量關係。孟德爾在山柳菊材料了耗費了幾年時間，寫出相關山柳菊雜交試驗論文，結果讓孟德爾大失所望，因為無法得到與豌豆實驗相似的結果，從而使得孟德爾不得不懷疑他用豌豆試驗得出的規律缺乏普遍性，這使得他不再堅持推廣他的科學，正好此時，他被推選為修道院院長，從而精力轉向行政管理，放棄了科學研究工作。

第五是他出生在錯誤的時代，出生在巨人的陰影之下。這個巨人就是達爾文。因為《物種起源》在生物界引發了一場革命，在哲學領域也掀起了一場大討論大變革。從事遺傳的工作者，他們的興趣都轉向了物種間的雜交，而不是物種內的雜交。孟德爾也不例外，他同樣研究過菜豆與山柳菊種間雜交的試驗，十分好笑的是，這些種間雜交試驗常常被植物學家提到包括拿格里，而他的著名的豌豆試驗卻是不值得一提。不知孟德爾是否給達爾文郵寄過他的論文？按當時的情況，他肯定郵寄過，那達爾文為什麼沒有看到過呢？至今還是一個謎。

因為比起其它自然科學三大發現，孟德爾遺傳定律還不夠格：

19世紀自然科學三大發現即：

1、細胞學說（1838-1839）

2、能量守恆定律（1842-1847）

3、生物進化論（1859）

19世紀的自然科學三大發現是指證明了自然界的各種物質運動形式，都可以在一定的條件下互相轉化的重大發現，同時證明了自然界中物質運動的統一性，為辯證唯物主義自然觀的創立奠定了基礎。