真核生物啟動子有三類，分別由RNA 聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ進行轉錄。
類別Ⅰ（class Ⅰ）啟動子：
只控制rRNA 前體基因的轉錄，轉錄產物經切割和加工後生成各種成熟rRNA 。 類別Ⅰ啟動子由兩部分保守序列組成：
核心啟動子（core promoter
）：位於轉錄起點附近，從-45至+20；
上游控制元件（upstream control element ，UCE ）：位於-180至-107；
RNA 聚合酶Ⅰ對其轉錄需要2種因子參與：
UBF1：一條M 為97000的多肽鏈，結合在上述兩部分的富含GC 區；
真核生物三類啟動子
1個TBP ，即TATA 結合蛋白（TA TA-binding protein ，TBP ）；
SL1：一個四聚體蛋白，含有 3個不同的轉錄輔助因子TAF Ⅰ；
在SL1因子介導下RNA 聚合酶Ⅰ結合在轉錄起點上並開始轉錄。
類別Ⅱ（class Ⅱ）啟動子：
類別Ⅱ啟動子涉及眾多編碼蛋白質的基因表達的控制。
該類啟動子包含4類控制元件：
基本啟動子（basal promoter ）：序列為中心在-25至-30左右的7 bp 保守區，TA TAAAA/T ，
稱為TATA 框或Goldberg-Hogness 框。與RNA 聚合酶的定
位有關，DNA 雙鏈在此解開並決定轉錄的起點位置。失去
TATA 框，轉錄將在許多位點上開始。 起始子（initiator ）：轉錄起點位置處的一保守序列，共有序列為：P y P y ANT(A)P y P y
P y 為嘧啶鹼（C 或T ），N 為任意鹼基，A 為轉錄的起點。DNA 在此
解開並起始轉錄。
上游元件（upstream factor ）：普遍存在的上游元件有CAAT 框、GC 框和八聚體（octamer ）
框等。CAAT 框的共有序列是GCCAATCT ，GC 框的共有序
列為GGGCGG 和CCGCCC ，八聚體框含有8bp ，共有序列
為ATGCAAA T ；
應答元件（response element ）：誘導調節產生的轉錄啟用因子與靶基因上的應答元件結合。
如熱休克效應元件HSE 的共有序列是
CNNGAANNTCCNNG ，可被熱休克因子HSF 識別和作用；
血清效應元件SRE 的共有序列CCA TATTAGG ，可被血清效
真核生物啟動子有三類，分別由RNA 聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ進行轉錄。
類別Ⅰ（class Ⅰ）啟動子：
只控制rRNA 前體基因的轉錄，轉錄產物經切割和加工後生成各種成熟rRNA 。 類別Ⅰ啟動子由兩部分保守序列組成：
核心啟動子（core promoter
）：位於轉錄起點附近，從-45至+20；
上游控制元件（upstream control element ，UCE ）：位於-180至-107；
RNA 聚合酶Ⅰ對其轉錄需要2種因子參與：
UBF1：一條M 為97000的多肽鏈，結合在上述兩部分的富含GC 區；
真核生物三類啟動子
1個TBP ，即TATA 結合蛋白（TA TA-binding protein ，TBP ）；
SL1：一個四聚體蛋白，含有 3個不同的轉錄輔助因子TAF Ⅰ；
在SL1因子介導下RNA 聚合酶Ⅰ結合在轉錄起點上並開始轉錄。
類別Ⅱ（class Ⅱ）啟動子：
類別Ⅱ啟動子涉及眾多編碼蛋白質的基因表達的控制。
該類啟動子包含4類控制元件：
基本啟動子（basal promoter ）：序列為中心在-25至-30左右的7 bp 保守區，TA TAAAA/T ，
真核生物三類啟動子
稱為TATA 框或Goldberg-Hogness 框。與RNA 聚合酶的定
位有關，DNA 雙鏈在此解開並決定轉錄的起點位置。失去
TATA 框，轉錄將在許多位點上開始。 起始子（initiator ）：轉錄起點位置處的一保守序列，共有序列為：P y P y ANT(A)P y P y
P y 為嘧啶鹼（C 或T ），N 為任意鹼基，A 為轉錄的起點。DNA 在此
解開並起始轉錄。
上游元件（upstream factor ）：普遍存在的上游元件有CAAT 框、GC 框和八聚體（octamer ）
框等。CAAT 框的共有序列是GCCAATCT ，GC 框的共有序
列為GGGCGG 和CCGCCC ，八聚體框含有8bp ，共有序列
為ATGCAAA T ；
應答元件（response element ）：誘導調節產生的轉錄啟用因子與靶基因上的應答元件結合。
如熱休克效應元件HSE 的共有序列是
CNNGAANNTCCNNG ，可被熱休克因子HSF 識別和作用；
血清效應元件SRE 的共有序列CCA TATTAGG ，可被血清效