ATP合成酶：指催化ADP和磷酸，利用能量形成ATP的酶。
2. ATP水解酶：指催化ATP水解形成ADP和磷酸，釋放能量的酶。
3.澱粉酶：主要由唾液腺分泌的唾液澱粉酶、胰腺分泌的胰澱粉酶和腸腺分泌的腸澱粉酶，可催化澱粉水解成麥芽糖。
4.麥芽糖酶：主要有胰腺分泌的胰麥芽糖酶和腸腺分泌的腸麥芽糖酶，可催化麥芽糖水解成葡萄糖。
5.蛋白酶：主要有胃腺分泌的胃蛋白酶和胰腺分泌的胰蛋白酶，可催化蛋白質水解成多肽和氨基酸。作用結果是破壞肽鍵和蛋白質的空間結構。
6.肽酶：由腸腺分泌，可催化多肽鏈水解成氨基酸。
7.脂肪酶：主要有胰腺分泌的胰脂肪酶和腸腺分泌的腸脂肪酶，可催化脂肪分解為脂肪酸和甘油。肝臟分泌的膽汁乳化脂肪形成脂肪微粒後，有利於脂肪分解。
8.轉氨酶：催化蛋白質代謝過程中氨基轉換過程。如人體的谷丙轉氨酶(GPT)，能夠把穀氨酸上的氨基轉移給丙酮酸，從而形成丙氨酸和a—酮戊二酸。由於谷丙轉氨酶在肝臟中的含量最多，當肝臟病變時谷丙轉氨酶就大量釋放到血液，因此臨床上常把化驗人體血液中這種酶的含量作為診斷是否患肝炎等疾病的一項重要指標。
9.纖維素酶和果膠酶：植物細胞工程中植物體細胞雜交時，需事先用纖維素酶和果膠酶分解植物細胞的細胞壁，從而獲得有活力的原生質體，然後誘導不同植物的原生質體融合。
10.胰蛋白酶：在動物細胞工程的動物細胞培養中，需要用胰蛋白酶將取自動物胚胎或幼齡動物的器官和組織分散成單個的細胞，然後配製成細胞懸浮液進行培養。或用於細胞傳代培養時將細胞從瓶壁上消化下來。
11. DNA聚合酶：在DNA複製中起作用，是以一條單鏈DNA為模板，將單個脫氧核苷酸透過磷酸二酯鍵形成一條與模板鏈互補的DNA鏈，形成鏈與母鏈構成一個DNA分子。
12.解旋酶：作用於氫鍵，是一類解開氫鍵的酶，由水解ATP來供給能量它們常常依賴於單鏈的存在，並能識別複製叉的單鏈結構。在細菌中類似的解旋酶很多，都具有ATP酶的活性。大部分的移動方向是5′3′，但也有3′5′移到的情況，如n′蛋白在φχ174以正鏈為模板合成複製形的過程中，就是按 3′5′移動。在DNA複製中起作用。
13.DNA連線酶：其功能是在兩個DNA片段之間形成磷酸二酯鍵。如果將經過同一種內切酶剪下而成的兩段DNA比喻為斷成兩截的梯子，那麼，DNA連線酶可以把梯子的“扶手”的斷口處(注意：不是連線鹼基對，鹼基對可以依靠氫鍵連線)，即兩條DNA黏性末端之間的縫隙“縫合”起來。據此，可在基因工程中用以連線目的基因和運載體。與DNA聚合酶的不同在於：不在單個脫氧核苷酸與DNA片段之間形成磷酸二酯鍵，而是將DNA雙鏈上的兩個缺口同時連線起來，因此DNA連線酶不需要模板
14.RNA聚合酶：又稱RNA複製酶、RNA合成酶，作用是以完整的雙鏈DNA為模板，邊解放邊轉錄形成mRNA，轉錄後DNA仍然保持雙鏈結構。對真核生物而言，RNA聚合酶包括三種：RNA聚合酶I轉錄rRNA，RNA聚合酶Ⅱ轉錄mRNA，RNA聚合酶Ⅲ轉錄tRNA和其她小分子RNA。在 RNA複製和轉錄中起作用。
15.逆（反）轉錄酶：為RNA指導的DNA聚合酶，催化以RNA為模板、以脫氧核糖核苷酸為原料合成DNA的過程。具有三種酶活性，即RNA指導的 DNA聚合酶，RNA酶，DNA指導的DNA聚合酶。在分子生物學技術中，作為重要的工具酶被廣泛用於建立基因文庫、獲得目的基因等工作。在基因工程中起作用。
16.限制性核酸內切酶(簡稱限制酶)：限制酶主要存在於微生物(細菌、黴菌等)中。一種限制酶只能識別一種特定的核苷酸序列，並且能在特定的切點上切割DNA分子，特異性地切斷DNA鏈中磷酸二酯鍵，發現於原核生物體內，現已分離出100多種。例如，從大腸桿菌中發現的一種限制酶只能識別GAATTC序列，並在G和A之間將這段序列切開。目前已經發現了200多種限制酶，它們的切點各不相同。蘇雲金芽孢桿菌中的抗蟲基因，就能被某種限制酶切割下來。
ATP合成酶：指催化ADP和磷酸，利用能量形成ATP的酶。
2. ATP水解酶：指催化ATP水解形成ADP和磷酸，釋放能量的酶。
3.澱粉酶：主要由唾液腺分泌的唾液澱粉酶、胰腺分泌的胰澱粉酶和腸腺分泌的腸澱粉酶，可催化澱粉水解成麥芽糖。
4.麥芽糖酶：主要有胰腺分泌的胰麥芽糖酶和腸腺分泌的腸麥芽糖酶，可催化麥芽糖水解成葡萄糖。
5.蛋白酶：主要有胃腺分泌的胃蛋白酶和胰腺分泌的胰蛋白酶，可催化蛋白質水解成多肽和氨基酸。作用結果是破壞肽鍵和蛋白質的空間結構。
6.肽酶：由腸腺分泌，可催化多肽鏈水解成氨基酸。
7.脂肪酶：主要有胰腺分泌的胰脂肪酶和腸腺分泌的腸脂肪酶，可催化脂肪分解為脂肪酸和甘油。肝臟分泌的膽汁乳化脂肪形成脂肪微粒後，有利於脂肪分解。
8.轉氨酶：催化蛋白質代謝過程中氨基轉換過程。如人體的谷丙轉氨酶(GPT)，能夠把穀氨酸上的氨基轉移給丙酮酸，從而形成丙氨酸和a—酮戊二酸。由於谷丙轉氨酶在肝臟中的含量最多，當肝臟病變時谷丙轉氨酶就大量釋放到血液，因此臨床上常把化驗人體血液中這種酶的含量作為診斷是否患肝炎等疾病的一項重要指標。
9.纖維素酶和果膠酶：植物細胞工程中植物體細胞雜交時，需事先用纖維素酶和果膠酶分解植物細胞的細胞壁，從而獲得有活力的原生質體，然後誘導不同植物的原生質體融合。
10.胰蛋白酶：在動物細胞工程的動物細胞培養中，需要用胰蛋白酶將取自動物胚胎或幼齡動物的器官和組織分散成單個的細胞，然後配製成細胞懸浮液進行培養。或用於細胞傳代培養時將細胞從瓶壁上消化下來。
11. DNA聚合酶：在DNA複製中起作用，是以一條單鏈DNA為模板，將單個脫氧核苷酸透過磷酸二酯鍵形成一條與模板鏈互補的DNA鏈，形成鏈與母鏈構成一個DNA分子。
12.解旋酶：作用於氫鍵，是一類解開氫鍵的酶，由水解ATP來供給能量它們常常依賴於單鏈的存在，並能識別複製叉的單鏈結構。在細菌中類似的解旋酶很多，都具有ATP酶的活性。大部分的移動方向是5′3′，但也有3′5′移到的情況，如n′蛋白在φχ174以正鏈為模板合成複製形的過程中，就是按 3′5′移動。在DNA複製中起作用。
13.DNA連線酶：其功能是在兩個DNA片段之間形成磷酸二酯鍵。如果將經過同一種內切酶剪下而成的兩段DNA比喻為斷成兩截的梯子，那麼，DNA連線酶可以把梯子的“扶手”的斷口處(注意：不是連線鹼基對，鹼基對可以依靠氫鍵連線)，即兩條DNA黏性末端之間的縫隙“縫合”起來。據此，可在基因工程中用以連線目的基因和運載體。與DNA聚合酶的不同在於：不在單個脫氧核苷酸與DNA片段之間形成磷酸二酯鍵，而是將DNA雙鏈上的兩個缺口同時連線起來，因此DNA連線酶不需要模板
14.RNA聚合酶：又稱RNA複製酶、RNA合成酶，作用是以完整的雙鏈DNA為模板，邊解放邊轉錄形成mRNA，轉錄後DNA仍然保持雙鏈結構。對真核生物而言，RNA聚合酶包括三種：RNA聚合酶I轉錄rRNA，RNA聚合酶Ⅱ轉錄mRNA，RNA聚合酶Ⅲ轉錄tRNA和其她小分子RNA。在 RNA複製和轉錄中起作用。
15.逆（反）轉錄酶：為RNA指導的DNA聚合酶，催化以RNA為模板、以脫氧核糖核苷酸為原料合成DNA的過程。具有三種酶活性，即RNA指導的 DNA聚合酶，RNA酶，DNA指導的DNA聚合酶。在分子生物學技術中，作為重要的工具酶被廣泛用於建立基因文庫、獲得目的基因等工作。在基因工程中起作用。
16.限制性核酸內切酶(簡稱限制酶)：限制酶主要存在於微生物(細菌、黴菌等)中。一種限制酶只能識別一種特定的核苷酸序列，並且能在特定的切點上切割DNA分子，特異性地切斷DNA鏈中磷酸二酯鍵，發現於原核生物體內，現已分離出100多種。例如，從大腸桿菌中發現的一種限制酶只能識別GAATTC序列，並在G和A之間將這段序列切開。目前已經發現了200多種限制酶，它們的切點各不相同。蘇雲金芽孢桿菌中的抗蟲基因，就能被某種限制酶切割下來。