細胞中的RNA主要有三類：rRNA約佔80％－85％，tRNA和核內小分子RNA約佔10%-15%，mRNA約佔1%-5%，由於rRNA佔絕大多數，因此我們用瓊脂糖凝膠電泳可以看到的即是rRNA，它也有三種類型：28S，18S，5S。所以我們看到的也應該是三條帶，而且28S的亮度為18S的兩倍。這樣的RNA才可以用來建庫。
在RNA的提取時，一定要注意RNase的汙染，因RNA極易被RNase的降解，操作時應儘量少說話，並在潔淨的環境中操作，主要防止手、唾液和空氣中Rnase的汙染；另一方面使用的所有玻璃儀器、移液器、吸頭和離心管都用0.5%DEPC溶液處理過夜,然後高壓滅菌15分鐘.但對於滅菌的一次性使用的塑膠製品基本上無RNase,，可以不經處理直接用於提取RNA，實驗室用的普通玻璃器皿和塑膠製品經常有Rnase汙染，使用前必須180度幹烤8小時或更長時間（玻璃器皿）或用氯仿沖洗（塑膠製品），另外，由於材料不同，機體內含有的糖、酚類物質不一樣，因此材料不同用的方法也應該不一樣。
下面是兩種提取方法，第一種適用於嫩組織或動物組織的總RNA的提取，第二種適用於老組織的提取。
試劑：提取緩衝液，KAc(5M), 異丙醇，無水乙醇，DEPC水
儀器：離心機，恆溫水浴鍋，研缽
方法一 動物、植物（嫩葉）的總RNA分離
大約2克植物組織或動物組織用液氮研磨
↓
加5mlTrizol裂解液
12000rpm ，4度，10分鐘
加入1ml氯仿
劇烈振盪15秒，室溫溫育2-3分鐘
室溫離心10分鐘，8000rpm
取上清，加入等體積的異丙醇，15-30度放置10分鐘。
12000g離心10分鐘
棄上清，加入10ml75%灑精洗沉澱。
2-8度下，不超過7500g離心5分鐘
棄上清，乾燥沉澱10分鐘
用DEPC水溶。
方法二 、植物老葉、老根或多糖含量高的材料的總RNA分離
1g組織液氮研磨，加入6ML提取緩衝液
2min振盪
65℃，20min
加入1.5MLKAc
混勻，冰浴20min
8000rpm,4℃,15min
取上清，加入0.6倍異丙醇，-20℃，1小時（或室溫15-20min）
12000rpm,4℃,15min
75%乙醇，12000rpm,20℃,5min
晾乾，溶60ulDEPC水，15min
12000rpm,4℃,5min, 上清即為RNA。
細胞中的RNA主要有三類：rRNA約佔80％－85％，tRNA和核內小分子RNA約佔10%-15%，mRNA約佔1%-5%，由於rRNA佔絕大多數，因此我們用瓊脂糖凝膠電泳可以看到的即是rRNA，它也有三種類型：28S，18S，5S。所以我們看到的也應該是三條帶，而且28S的亮度為18S的兩倍。這樣的RNA才可以用來建庫。
在RNA的提取時，一定要注意RNase的汙染，因RNA極易被RNase的降解，操作時應儘量少說話，並在潔淨的環境中操作，主要防止手、唾液和空氣中Rnase的汙染；另一方面使用的所有玻璃儀器、移液器、吸頭和離心管都用0.5%DEPC溶液處理過夜,然後高壓滅菌15分鐘.但對於滅菌的一次性使用的塑膠製品基本上無RNase,，可以不經處理直接用於提取RNA，實驗室用的普通玻璃器皿和塑膠製品經常有Rnase汙染，使用前必須180度幹烤8小時或更長時間（玻璃器皿）或用氯仿沖洗（塑膠製品），另外，由於材料不同，機體內含有的糖、酚類物質不一樣，因此材料不同用的方法也應該不一樣。
下面是兩種提取方法，第一種適用於嫩組織或動物組織的總RNA的提取，第二種適用於老組織的提取。
試劑：提取緩衝液，KAc(5M), 異丙醇，無水乙醇，DEPC水
儀器：離心機，恆溫水浴鍋，研缽
方法一 動物、植物（嫩葉）的總RNA分離
大約2克植物組織或動物組織用液氮研磨
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加5mlTrizol裂解液
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12000rpm ，4度，10分鐘
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加入1ml氯仿
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劇烈振盪15秒，室溫溫育2-3分鐘
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室溫離心10分鐘，8000rpm
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取上清，加入等體積的異丙醇，15-30度放置10分鐘。
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12000g離心10分鐘
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棄上清，加入10ml75%灑精洗沉澱。
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2-8度下，不超過7500g離心5分鐘
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棄上清，乾燥沉澱10分鐘
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用DEPC水溶。
方法二 、植物老葉、老根或多糖含量高的材料的總RNA分離
1g組織液氮研磨，加入6ML提取緩衝液
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2min振盪
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65℃，20min
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加入1.5MLKAc
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混勻，冰浴20min
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8000rpm,4℃,15min
取上清，加入0.6倍異丙醇，-20℃，1小時（或室溫15-20min）
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12000rpm,4℃,15min
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75%乙醇，12000rpm,20℃,5min
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晾乾，溶60ulDEPC水，15min
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12000rpm,4℃,5min, 上清即為RNA。