蚯蚓在醫藥中的用途很廣，中國民間早就積累了十分豐富的經驗。明代著名醫學家李時珍認為：“蚯蚓性鹹寒、無毒”，在《本草綱目》中記述歷代驗方達40餘種。

蚯蚓最重要的醫藥價值是從蚯蚓體內提取蚓激酶(C—PPA)，已受到大陸外人士的關注和重視。蚓激酶也是一切特種水產動物最好的誘食劑和“性激素”助劑。

蚯蚓作為食品，目前人們尚沒有這種習慣。但是，日本一些營養學家認為：“像蚯蚓這種營養價值高的動物，可能有一天會成為人類肉食的重要來源”。因為蚯蚓的蛋白質超過大部分動物肉的含量，而且在蛋白質的組成中，具有人體必需的8種氨基酸。此外，還含9％一10％具有鮮味的穀氨酸。

蚯蚓具有旺盛的吞食土壤和有機垃圾的能力，除金屬、玻璃、橡膠、塑膠外，經過發酵的有機垃圾，透過蚯蚓的消化系統，在各種酶的作用下，能迅速分解、轉化，成為自身或其他生物易於利用的營養物質。因此，利用蚯蚓可處理城市垃圾以及造紙、釀酒、食品、屠宰、製革、果品加工等工業的廢渣、汙泥。這樣既可化害為利、變廢為肥，又可利用廢物養殖蚯蚓，既生產優質的動物蛋白原料，又生產肥沃的複合有機肥料，一舉兩得。

蚯蚓除了有鬆土效應和土質改良的作用外，蚓糞的綜合肥力功用是任何化肥和農家肥不可比擬的。蚓糞是有自然氣孔率提高生長速度和繁殖率。蚓類用作特種水產動物的飼料新增劑和誘食劑，具有特殊的效應。同時，把蚯蚓糞配入水中，能緩解池水發臭作用，有效地控制一些疾病的發生。