原因之一：二者作用機理與化學特性不同。

氯氟吡氧乙酸屬吡啶類內吸傳導型苗後除草劑。多種闊葉雜草對此比較敏感且作用迅速，雜草受害後表現出畸形扭曲致死的典型激素類除草劑表象特徵。

如圖1：氯氟吡氧乙酸激素型吡啶類除草劑。

草甘膦屬有機磷內吸傳導型廣譜滅生性除草劑。作用部位是雜草的分生組織。雜草受害後出現黃化，褐變然後枯死。

如圖2：草甘膦有機磷類滅生性除草劑。

原因之二：二者混用除草更徹底。

雖然草甘膦是滅生性除草劑，幾乎對所有的雜草都有殺傷作用。但是因為種種客觀原因，還是有除草不徹底的"死角"。

如圖3：草甘膦除草不徹底的"死角"。

草甘膦對"狗牙根，過江龍，竹葉草，辣蓼"等仿效甚差。低溫時對車前草，過路黃等雜草效果不突出。

如圖4：草甘膦對大齡竹葉草仿效差。

如圖5：草甘膦低溫情況下對車前過路黃仿效差

但是，氯氟吡氧乙酸在實際運用中對此類雜草仿效突出，彌補了草甘膦缺陷，使除草效果更加明顯。

原因之三：用草甘膦除草時，低溫或者乾旱條件下除草效果不好。勾兌藥劑時對水質也有要求。用渾濁河水或硬水配製的藥液效果較差。且對部分多年生雜草在加大濃度的情況下，效果一般。

如圖6：異型莎草。

而氯氟吡氧乙酸則對除草溫度，水質和雜草大小都沒有特殊要求。只要是敏感雜草，小至剛出土的子葉大致株高七八十公分十多個分枝的雜草都會一掃而光除草效果良好。

原因之四：生產實踐證明，二者混用沒有拮抗作用只有增效作用。