蘑菇的生產進入尾聲，棚室消毒成為當前菇農的首要工作，提高消毒殺菌效果的方法如下：

1、清棚消毒。將棚內的食用菌生產廢袋全部清除出棚，打掃乾淨。因為食用菌生產後的廢料容易滋生雜菌，導致棚內病原孢子量增大，所以要清除徹底。

2、藥劑消毒。在使用藥劑對菇棚進行殺菌時，菇農可選擇硫磺、甲醛-高錳酸鉀、二氯異氰尿酸鈉等燻蒸殺菌。在這三者之中，硫磺燃燒後產生的二氧化硫能夠起到殺菌殺蟲的雙重效果，但是在使用時產生的二氧化硫也容易與空氣中的水蒸氣反應，形成亞硫酸，腐蝕菇棚內的鋼絲等。在使用甲醛-高錳酸鉀消毒時，則要注意先倒粉劑後倒水劑，即先將高錳酸鉀倒入容器中，然後再將甲醛倒在高錳酸鉀上，切勿顛倒使用順序，甲醛與高錳酸鉀反應劇烈，要防止藥液濺到身上。使用二氯異氰尿酸鈉方法最為簡單，只要按照每立方米空間3克的使用量，在棚內按照每667平方米設置15-25個點，將藥劑點燃使用即可。當然有條件的菇農最好先將菇棚上部的棚膜撤掉，利用太Sunny中的紫外線殺菌，然後在食用菌種植之前，再使用藥劑消毒。

3、通風排氣。當菇棚殺菌消毒完成後，菇農還要注意及時進行通風，將棚室內的有毒氣體排出棚外，防止以後食用菌生產時，有毒氣體影響食用菌的生長。

1、菇棚環境的消毒。對栽培棚外包括操作場地周邊進行嚴格清理，尤其要徹底清理汙染菌袋以及菌糠廢料等，並噴灑高濃度多菌靈、辛硫磷混合液等進行殺菌殺蟲，環境差者應連續用藥兩次。

2、新菇棚的消毒。棚內可使用百病去無蹤、辛硫磷等藥物，一般用量為1袋百病去無蹤配50克辛硫磷，噴30平方米左右，用藥目標為地面、牆體以及立柱等，要求地毯式噴灑，然後密封菇棚，捲起草苫曬棚，密封2天后即可進袋發菌或出菇；發菌和出菇期間的預防用藥，可每5天左右噴灑一次蘑菇殺病靈或百病去無蹤，但要注意不要直噴子實體。

3、舊菇棚的消毒：連續使用多年的菇棚，要徹底進行消毒處理。一般可按1袋百病去無蹤配40克辛硫磷藥物，地毯式噴灑20平方米左右，然後密封菇棚，捲起草苫曬棚，密封2天后，再次用藥並繼續密閉曬棚，2-7天后，方可進袋發菌。